java - 无法在 Ubuntu 13.04 的 R 3.0 中安装 rJava

Question

我无法调用 R 3.0 中的 rJava 包。我收到以下消息

Error: package ‘rJava’ was built before R 3.0.0: please re-install it

当我尝试重新安装 rJava 包时出现错误。我提供了 R CMD javareconf

的输出

Java interpreter : /usr/bin/java
Java version     : 1.7.0_21
Java home path   : /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre
Java compiler    : /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre/../bin/javac
Java headers gen.: /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre/../bin/javah
Java archive tool: /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre/../bin/jar

trying to compile and link a JNI progam 
detected JNI cpp flags    : 
detected JNI linker flags : 
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O2 -pipe -g  -c conftest.c -o conftest.o
conftest.c:1:17: fatal error: jni.h: No such file or directory
compilation terminated.
make: *** [conftest.o] Error 1
Unable to compile a JNI program


Java library path: 
JNI cpp flags    : 
JNI linker flags : 
Updating Java configuration in /usr/lib/R
Done.

我使用的是 Ubuntu 13.04。我还尝试了 apt-get install r-cran-rjava ，但这无助于解决问题。关于 jni.h 有一些解决方案 here.但是，不确定如何使用这里的解决方案。

Answer 1

我遇到了完全相同的问题。我的解决方案是通过安装 openjdk-7-*

sudo apt-get install openjdk-7-*

接着是

sudo R CMD javareconf

然后我就可以通过 install.packages("rJava") 在 R 中安装 rJava。

虽然可能不是最优雅的解决方案，但它似乎解决了我让 rJava 工作的问题。