r - R 3.6 的 arrayQualityMetrics 包和 GEOquery 的来源是什么

Question

每次我尝试在 R 3.6 中安装新包时，都会出现错误，因此我需要知道 R 3.6 的“arrayQualityMetrics”和“GEOquery”包的来源

Answer 1

r的生物包(如arrayQualityMetrics包和GEOquery)的来源是bioconductor网站(https://bioconductor.org/)

在 r v3.6 中安装 arrayQualityMetrics 包:

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("arrayQualityMetrics")

在 r v3.6 中安装 GEOquery 包:

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("GEOquery")

在 r v3.4 中安装 arrayQualityMetrics 包:

## try http:// if https:// URLs are not supported
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("arrayQualityMetrics")

在 r v3.4 中安装 GEOquery 包:

## try http:// if https:// URLs are not supported
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("GEOquery")

在以前的版本中安装生物包:

解决方案 1:在以下链接中选择您的 r 版本，然后搜索包。 install biological package for Previous Releases r.

在以前的版本中安装生物包:

解决方案 2:

setRepositories()
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install.packages("arrayQualityMetrics")
install.packages("GEOquery")