python - 在作业文件中加载 virtualenv 以在 linux 集群上运行

Question

我正在尝试设置一个作业文件以使用

在 linux 集群上运行

$ qsub network.job 

我已经加载了执行脚本所需的模块，但是还需要激活模块附带的虚拟环境。

#$ -S /bin/bash
#$ -cwd
#$ -j y
#$ -o output/
echo "Running job script"

module load python/python3

./network.py 
echo "Finished job script"

包括

$source activate machinelearning

不激活虚拟环境

我需要在文件中添加什么来激活加载模块python/python3时自带的virtualenv机器学习？

Answer 1

source /PATH/WHERE/YOUR/VIRTUAL/ENVIRONMENT/EXISTS/bin/activate

例如在你的 homedir 的子目录 venv 中

source ~/venv/machinelearning/bin/activate