python - 在接下来的 10 个字符中查找 python 中的各种字符串重复

Question

所以我正在解决一个问题，在遇到初始字符串后我必须找到各种重复的字符串，假设我们采用 ACTGAC，因此数据文件的序列如下所示:

AAACTGACACCATCGATCAGAACCTGA

因此，在该字符串中，一旦我们找到 ACTGAC，我就需要分析接下来的 10 个字符，以查找遵循某些规则的字符串重复。我对规则进行了编码，但谁能告诉我如何在找到所需的字符串后，为接下来的十个字符创建一个子字符串以进行分析。我知道 str.partition 函数可以在找到字符串后执行此操作，然后 [1:10] 可以获得接下来的十个字符。

谢谢!

Answer 1

您几乎已经知道了(但请注意，索引在 Python 中从 0 开始计数)。

partition 方法将根据 separator 的首次出现将字符串拆分为 head, separator, tail。

所以你只需要截取tail的前十个字符:

>>> data = 'AAACTGACACCATCGATCAGAACCTGA'
>>> head, sep, tail = data.partition('ACTGAC')
>>> tail[:10]
'ACCATCGATC'

Python 允许您省略切片中的起始索引(默认为零 - 字符串的开头)，以及结束索引(默认为字符串的长度)。

请注意，您也可以在一行中完成整个操作，如下所示:

>>> data.partition('ACTGAC')[2][:10]
'ACCATCGATC'