linux - 如何在 linux 中删除包含 NA 的列

Question

我想删除包含任意数量 NA 的列。我用了这个命令

awk '$0 !="NA"{print $0}' 文件

但它不起作用。例如文件如下

1  2 3 NA  6  male
4  6 2 1   NA female
NA 2 2 NA  3  male
7  2 2 7   NA male

我想输出文件为

  2 3 male
  6 2 female
  2 2 male
  2 2 male

Answer 1

您需要对数据进行两次传递。第一步应该将所有输入保存在一个数组中，找到包含 NA 的列号，并将其保存在另一个数组中。然后在最后打印所有保存的数据，但跳过第二个数组中的列。

awk '{ lines[NR] = $0; for (i = 1; i <= NF; i++) if ($i == "NA") skip[i] = 1;}
     END { for (i = 1; i <= NR; i++) {
            nf = split(lines[i], fields);
            for (j = 1; j <= nf; j++) if (!(j in skip)) printf("%s ", fields[j]);
            printf("\n");
           } 
         }' inputfile > outputfile