python - 当该依赖项是 numpy/scipy/...(其他一些)时，pip install 没有正确处理依赖项？

Question

我正在构建一个 virtualenv(系统详细信息如下)，numpy、scipy 和 pandas 似乎没有被正确地视为依赖项。

澄清一下，无论 numpy 是否出现在 requirements.txt 中，这个问题似乎都存在，即使它们以正确的顺序放置也是如此。

这很不方便，我认为这与包管理器的工作方式相反:)

那么是什么给了？当我从头开始构建 virtualenv 时，这是输出:

[bdundee@etl-dev Py26]$ ls
requirements.txt  requirements.txt~
[bdundee@etl-dev Py26]$ virtualenv ./env/sqrt_python26 --no-site-packages
New python executable in ./env/sqrt_python26/bin/python
Installing setuptools, pip...done.
[bdundee@etl-devPy26]$ source ./env/sqrt_python26/bin/activate
(sqrt_python26)[bdundee@etl-devPy26]$ pip install -r ./requirements.txt 
Downloading/unpacking Bottleneck==0.8.0 (from -r ./requirements.txt (line 6))

...

    import numpy as np

ImportError: No module named numpy

很明显，numpy 应该被视为 Bottleneck 的依赖项，但事实并非如此。 matplotlib 也会出现同样的问题。

Bottleneck 不是唯一存在此问题的模块，还有其他一些模块。这迫使我创建 pre_pip.sh:

#!/usr/bin/bash

## Install numpy                                                                                                                                                                      
pip install numpy==1.7.1

## Install scipy                                                                                                                                                                      
pip install scipy==0.12.0

## Install pandas                                                                                                                                                                     
pip install pandas==0.12.0

我也遇到了 scipy 和 pandas(例如，statsmodels)的错误。

问题:

• 这些软件包的安装说明中是否存在这些错误？
• 这是 numpy 特有的东西吗？
• 有没有安装 numpy、scipy 和 pandas 的“预”构建脚本来解决这个问题的方法？

系统详情:

• AWS CentOS(无论当前版本是什么)
• python 2.6.9
• numpy 1.7.1

Answer 1

pip 似乎按如下方式工作(请随时纠正我)。

• 下载并解压缩每个文件。
• 构建每个文件python setup.py build
• 安装每个文件python setup.py install

问题是某些模块中的 setup.py 文件要求在构建或安装步骤中出现有问题的模块，如果 numpy/scipy/等，这是不可能的。在 requirements.txt 中。

A similar issue存在于 matplotlib，pip 社区的观 pip 是“它不是 pip”。很公平。

在我看来，最好的解决方法是只编写一个包装器。如果有人知道更好的方法，请告诉我:)

#!/usr/bin/bash

INSTALL_DIR=$IMPORT/../Environment/Py26/env/sqrt_python26

## Step 1: build the virtualenv
virtualenv $INSTALL_DIR

## Now use the virtualenv
source $INSTALL_DIR/bin/activate

## Install numpy
pip install numpy==1.7.1

## Install scipy
pip install scipy==0.12.0

## Install pandas
pip install pandas==0.12.0

## Some others...
pip install patsy==0.2.1
pip install pycurl==7.19.0

## Now run requirements.txt
pip install -r ./requirements.txt

## finished, shut down virtualenv
deactivate