我想遍历 linux 目录中的几个文件,如下所示:
SRR057629_1.fastq.gz SRR057629_2.fastq.gz SRR057630_1.fastq.gz
SRR057630_2.fastq.gz SRR057631_1.fastq.gz SRR057631_2.fastq.gz
SRR057632_1.fastq.gz SRR057632_2.fastq.gz SRR057633_1.fastq.gz
SRR057633_2.fastq.gz
我面临的挑战是我需要 SRR..._1
和 SRR..._2
作为一个命令 (tophat2) 的输入,然后执行下一个命令SRR***_1
和 SRR***_2
用于同一命令。原则上它看起来像这样:
tophat2 -G /Homo_sapiens/UCSC/hg19/Annotation/Genes/genes.gtf /Homo_sapiens /UCSC/hg19/Sequence/Bowtie2Index/genome SRR057636_1.fastq.gz SRR057636_2.fastq.gz
tophat2 -G /Homo_sapiens/UCSC/hg19/Annotation/Genes/genes.gtf /Homo_sapiens/UCSC/hg19/Sequence/Bowtie2Index/genome SRR057637_1.fastq.gz SRR057637_2.fastq.gz
那么我该如何为每个命令更改这些数字(粗体)?
SRR0576**29**_1.fastq.gz
SRR0576**29**_1.fastq.gz
祝你好运,西蒙
我是一名优秀的程序员,十分优秀!