r - linux 命令行中的 knitr

Question

我知道下面的代码可以在 linux 的终端中将 Rnw 文件编织成 pdf，但是行太多了，而对于 Rstudio 来说，这样做只需要单击一下。有人可以提供一个 linux shell 函数来将文件名作为变量处理吗？例如，我尝试使用 $1，但是 Rscript 和 Rnw 文件名有 ""和 ''，shell 无法识别 $1 是什么。

Rscript -e "library(knitr); knit('my_sweave_file.Rnw')"
    pdflatex my_sweave_file.tex

Answer 1

你可以使用这样的东西。另存为文件并确保它可以运行(即使用 chmod +x nameofscript)。

#!/bin/bash

# Set the first argument as variable file    
file=$1

filename=$(basename "$file")
extension="${filename##*.}"
filename="${filename%.*}"

Rscript -e "library(knitr); knit('$file')" ; pdflatex $filename.tex