Python - 从 3D 数组写入三维图像

Question

我正在尝试从 3D 阵列获取图像并将其转换为 TIF 3D。我正在使用简单的 ITK，但它不起作用。我收到此错误消息:'in method 'WriteImage', argument 1 of type 'itk::simple::Image const &'

这是我的代码:

import numpy as np
import SimpleITK as sitk

test = np.ones((20,20,20))

sitk.WriteImage(test,'test.tif')

-------------------- 稍后编辑------------------------ ---

我尝试使用“GetImageFromArray”，它似乎有效，因为我保持相同的大小，最后我尝试保存但出现错误:

“itk::ERROR: TIFFImageIO(0x43e8740): TIFF 支持无符号/有符号字符、无符号/有符号短整数和 float ”

这是我的代码:

test2 = sitk.GetImageFromArray(test)
test2.GetSize()
(20, 20, 20)
sitk.WriteImage(test2, "prout.tif")

Answer 1

看起来 TIFF ImageIO 不支持您的 sitk::Image 像素类型。您需要转换为列出的其中一种像素类型，即 sitk.UInt8、sitk.UInt16、sitk.Float32。

您可以检查当前的像素类型是什么，例如:

print("pixel id: {0} ({2})".format(test2.GetPixelID(), test2.GetPixelIDTypeAsString())

然后您可以转换图像的像素类型:

test2 = sitk.Cast(test2, sitk.Float32)

或

test2 = sitk.Cast(test2, sitk.UInt16)

等...