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linux - 如何使用 SED 删除不是 [ACGTN] 的字符

转载作者：太空宇宙更新时间：2023-11-04 09:50:47

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如何用 sed 替换任何不是“A”、“C”、“G”、“T”、“N”的字符串？

例如我有以下数据:

>AFCCCCC 1
cagktgagtgataaggc
>AFCGH22 1
cagntgagtgstaaggc

我想删除行中不以“>”开头的每个不是 [ACGTN] 的字符

因此我希望得到这样的输出:

 >AFCCCCC 1
 cagtgagtgataaggc
 >AFCGH22 1
 cagntgagtgtaaggc

请注意，我删除了第一个和第二个序列的“k”和“s”。

最佳答案

试试这个:

sed '/^>/!s/[^ACGTN]//ig' input.txt

关于linux - 如何使用 SED 删除不是 [ACGTN] 的字符，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/11354065/

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