regex - 使用正则表达式批量重命名 *fastq.gz 文件

Question

我正在尝试让正则表达式与 rename 一起工作；我在这里尝试了类似回答问题的方法，但无法获得我想要的结果。

文件是这样命名的:

SR1_S90_L001_R1_001.fastq.gz 
SR1_S90_L001_R2_001.fastq.gz
Rinc_S96_L001_R1_001.fastq.gz 
Rinc_S96_L001_R2_001.fastq.gz

我想仅保留第一个下划线和_R1_或_R2_标签之前的信息，如下所示:

SR1_R1_.fastq.gz 
SR1_R2_.fastq.gz
Rinc_R1_.fastq.gz 
Rinc_R2_.fastq.gz

Answer 1

rename 's{^([^._]+)_[^.]*(_R[12]_)[^.]*}{$1$2}' *

想法是匹配(并捕获)字符串的第一部分(1 个或多个不是. 或_ 的字符)，然后是 _ 和 0 个或多个非 . 字符，后跟 _R1_ 或 _R2_(我们也捕获了这部分)，后跟0 个或多个非 . 字符。

这应该匹配文件名的第一部分(在 . 之前)并将其替换为第一个和第二个捕获的子字符串，即第一个 _ 和 R1 之前的所有内容/R2 标签。