python - 在 Linux 服务器上使用 pip 安装 scipy

Question

我在 linux 系统上安装 scipy 时遇到问题。以前有人问过这个问题，但我无法确切地找出解决方案，尤其是最新的解决方案是什么，因为似乎很多这些存储库都在不断更新，解决方案可能也是如此。我想在上一篇关于这个问题的帖子中发布这个，但注意到我应该只提供一个问题的答案，而不是在那里发布我的问题!所以我在这里创建一个新帖子。我知道这篇文章会被否决、屏蔽、责备……但请善待我，指出我可能遇到的问题到底是什么。我在网上搜索过，特别是在 stackoverflow 上搜索了在我正在使用的 linux 系统中安装 scipy 的方法，并且据我所知和能力(有限，我不是软件专业人士)已经使用了这里发布的各种建议。所以这就是我所拥有的:1)我在linux系统上:

Linux compute-0-25.local 2.6.18-164.el5 #1 SMP Tue Aug 18 15:51:48 EDT 2009 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux

2) 安装virtualenv，创建并激活虚拟环境:

curl -O -k https://pypi.python.org/packages/source/v/virtualenv/virtualenv-1.9.1.tar.gz
tar xvfz virtualenv-1.9.1.tar.gz
cd virtualenv-1.9.1
/usr/local/python/2.6.5/bin/python virtualenv.py myVE
. virtualenv-1.9.1/myVE/bin/activate

3) 安装 numpy:

pip install numpy

4) 尝试安装 scipy:

pip install scipy

在 pip.log 文件中出现以下错误: https://gist.github.com/hariiyer16/5910959

也尝试过(基于此处之前的帖子):

pip 安装 git+ http://github.com/scipy/scipy/

但这并没有奏效。还尝试了 easy_install 但没有用。如果有帮助，也会发布这些错误。

通过阅读之前的一些帖子，我可能必须获得 scipy 依赖项(libamd2.2.0 libblas3gf libc6 libgcc1 libgfortran3 liblapack3gf libumfpack5.4.0 libstdc++6 build-essential gfortran libatlas-sse2-dev python-all-dev ).有人可以告诉我是否是这样吗？在那种情况下，我必须与我们的管理员联系，因为我没有 super 用户权限(只能在我的目录中安装东西)。但在询问管理员之前，我想确定需要安装哪些依赖项。如果能得到一些建议和一些反对意见，那就太好了。真的很感激。以前，我能够在我的 Mac(雪豹)上安装 numpy、scipy 等，得到这里的人的帮助，对此我表示感谢。但是这个非常令人生畏，并且在它上面花费了太多时间。

谢谢。

Answer 1

经过大量尝试，我在新的虚拟环境中全新安装了 Python。由于我进行的是全新安装，因此我选择了 Python 2.7.5。然后激活虚拟环境。然后用pip install安装了numpy和scipy，还是不行! (不知道为什么。很高兴知道是否有人有线索)。但是，尝试了 easy_install 并且 numpy 和 scipy 都有效。很高兴它起作用了，但我不会安然休眠，因为不知道真正的问题是什么。以下是完整代码:

1) 安装python

wget http://www.python.org/ftp/python/2.7.5/Python-2.7.5.tgz
tar -zxvf Python-2.7.5.tgz
mkdir ~/Python-2.7
cd Python-2.7.5
make clean
./configure --help #get to know the options in configure
./configure --help | grep -i ucs $get to know the UCS options
./configure --prefix=/home/org/username/Python-2.7 #install Python in the Python-2.7 directory
make
make install

2) 在新的 Python-2.7.5 安装中安装 virtualenv(virtualenv-1.9.1.tar.gz 被解压到一个名为 virtualenv-1.9.1 的文件夹中)

cd virtualenv-1.9.1/
~/Python-2.7/bin/python setup.py install #this installs virtualenv in the new Python directory
cd ..

3) 使用本地 python 创建一个 virtualenv

mkdir ~/virtualenv-1.9.1/myVE_Python2.7
cd ~/virtualenv-1.9.1/myVE_Python2.7
~/Python-2.7/bin/virtualenv py2.7 --python=/home/org/username/Python-2.7/bin/python2.7

4) 激活环境

ls -l virtualenv-1.9.1/myVE_Python2.7/py2.7/bin/
. virtualenv-1.9.1/myVE_Python2.7/py2.7/bin/activate

5) 使用 easy_install 安装 numpy 和 scipy

ls -l virtualenv-1.9.1/myVE_Python2.7/py2.7/bin/
easy_install -U setuptools

出于某种原因，pip install 安装了 UCS4 版本的 numpy，它与 UCS2 版本的 Python 版本不兼容。所以必须对 numpy 和 scipy 使用 easy_install(好吧，这是我的最佳猜测)。

easy_install numpy
easy_install scipy
ls -l /home/org/username/virtualenv-1.9.1/myVE_Python2.7/py2.7/lib/python2.7/site-packages

发现以下帖子有用: Is it possible to install another version of Python to Virtualenv?

Installing SciPy with pip

How to find out if Python is compiled with UCS-2 or UCS-4?

http://www.cyberciti.biz/faq/debian-ubuntu-centos-rhel-linux-install-pipclient/

Use different Python version with virtualenv

谢谢。