linux - 多次启动程序

Question

我使用的是 Mac 操作系统。这是启动我的程序的命令行代码(两部分)

nucmer --mum file1.txt file2.txt

show-snps -Clr -x 2 out.delta > out_file1.snps

程序的第一部分创建文件 out.delta。我的 file2.txt 总是一样的，但我想用不同的 file1.txt 启动这两个部分 35000 次。所有文件都位于同一目录中。

是否可以使用 BASH 来实现？

Answer 1

将所有输入文件保存在一个目录中。创建包装器脚本以调用 nucmer 脚本，然后调用 show-snps 脚本。您的包装器脚本将接受文件目录的路径作为输入。遍历目录中的所有文件并调用您的两个脚本。