linux - 在 Linux 上从多个文件中删除冒号

Question

我正在尝试获取一些目录并将它们从 Linux 转移到 Windows。问题是 Linux 上的文件中有冒号。我需要将这些目录(我不能直接更改它们，因为它们是服务器，因此需要它们)复制到具有 Windows 可以使用的名称的文件中。例如，服务器上目录的名称可能是:

IAPLTR2b-ERVK-LTR_chr9:113137544-113137860_-

当我需要它时:

IAPLTR2b-ERVK-LTR_chr9-113137544-113137860_-

我有大约 60 个这样的目录，我收集了文件的名称及其绝对路径，并将其保存在一个名为 directories.txt 的文件中。我需要遍历此文件，将冒号更改为连字符。到目前为止，我的尝试是这样的:

#!/bin/bash

$DIRECTORIES=`cat directories.txt`
for $i in $DIRECTORIES;
do
    cp -r  "$DIRECTORIES" "`echo $DIRECTORIES | sed 's/:/-/'`"
done

但是我得到了错误:

./my_shellscript.sh: 第 10 行:=/bigpartition1/JKim_Test/test_bs_1/129c-test-biq/IAPLTR1_Mm-ERVK-LTR_chr10:104272652-104273004_+.fasta: 没有这样的文件或目录./my_shellscript.sh:第 14 行:`$i':不是有效的标识符

这里有人可以帮助我确定我做错了什么以及我可能需要做什么吗？

提前致谢。

Answer 1

这个怪物会在原地重命名目录:

find tmp -depth -type d -exec sh -c '[ -d "{}" ] && echo mv "{}" "$(echo "{}" | tr : _)"' \;

我使用 -depth 所以它首先下降到最深的子目录。
[ -d "{}"] 是必需的，因为一旦重命名子目录，其父目录(由 find 找到)可能不再存在(已重命名)。

如果您满意，将“echo mv”更改为“mv”，它会执行您想要的操作。