python - 将矩阵形式的 pandas dataframe 转换为表格

Question

我有以下形式的数据框:

   P  Q  R  S
A  0  2  1  1
B  2  0  1  1
C  1  1  0  0
D  1  1  0  0

我想把它改成下面的形式:

A P 0
A Q 2
A R 1
A S 1
B P 2
B Q 0
B R 1
B S 1 and so on...

基本上，格式是:

Row Column Value

我希望以这种方式转换数据，以便能够将其输入 Cytoscape 以绘制图表。

pandas 中是否有任何内置函数可用于此转换？

Answer 1

您可以使用 stack与 reset_index :

df = df.stack().reset_index()
df.columns = ['a','b','c']
print df
    a  b  c
0   A  P  0
1   A  Q  2
2   A  R  1
3   A  S  1
4   B  P  2
5   B  Q  0
6   B  R  1
7   B  S  1
8   C  P  1
9   C  Q  1
10  C  R  0
11  C  S  0
12  D  P  1
13  D  Q  1
14  D  R  0
15  D  S  0