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我想在 Python 中使用 Delaunay 三角剖分来对 3D 中的点进行插值。
我有的是
# my array of points
points = [[1,2,3], [2,3,4], ...]
# my array of values
values = [7, 8, ...]
# an object with triangulation
tri = Delaunay(points)
# a set of points at which I want to interpolate
p = [[1.5, 2.5, 3.5], ...]
# this gets simplexes that contain given points
s = tri.find_simplex(p)
# this gets vertices for the simplexes
v = tri.vertices[s]
我只能找到一个 answer这里建议使用 transform
方法进行插值,但没有更具体。
我需要知道的是如何使用包含单纯形的顶点来获取线性插值的权重。让我们假设一个一般的 n-dim 情况,以便答案不依赖于维度。
编辑:我不想使用 LinearNDInterpolator 或类似的方法,因为我在每个点都没有数字作为值,而是更复杂的东西(数组/函数)。
最佳答案
经过一些试验,解决方案看起来很简单(这个 post 很有帮助):
# dimension of the problem (in this example I use 3D grid,
# but the method works for any dimension n>=2)
n = 3
# my array of grid points (array of n-dimensional coordinates)
points = [[1,2,3], [2,3,4], ...]
# each point has some assigned value that will be interpolated
# (e.g. a float, but it can be a function or anything else)
values = [7, 8, ...]
# a set of points at which I want to interpolate (it must be a NumPy array)
p = np.array([[1.5, 2.5, 3.5], [1.1, 2.2, 3.3], ...])
# create an object with triangulation
tri = Delaunay(points)
# find simplexes that contain interpolated points
s = tri.find_simplex(p)
# get the vertices for each simplex
v = tri.vertices[s]
# get transform matrices for each simplex (see explanation bellow)
m = tri.transform[s]
# for each interpolated point p, mutliply the transform matrix by
# vector p-r, where r=m[:,n,:] is one of the simplex vertices to which
# the matrix m is related to (again, see bellow)
b = np.einsum('ijk,ik->ij', m[:,:n,:n], p-m[:,n,:])
# get the weights for the vertices; `b` contains an n-dimensional vector
# with weights for all but the last vertices of the simplex
# (note that for n-D grid, each simplex consists of n+1 vertices);
# the remaining weight for the last vertex can be copmuted from
# the condition that sum of weights must be equal to 1
w = np.c_[b, 1-b.sum(axis=1)]
理解的关键方法是transform ,这是简要记录的,但是文档说了所有需要说的。对于每个单纯形,transform[:,:n,:n]
包含变换矩阵,transform[:,n,:]
包含向量 r,该矩阵是相关的。看起来 r 向量被选为单纯形的最后一个顶点。
另一个棘手的问题是如何获取b
,因为我想做的是类似
for i in range(len(p)): b[i] = m[i,:n,:n].dot(p[i]-m[i,n,:])
本质上,我需要一个点积数组,而 dot
给出两个数组的积。像上面那样对单个单纯形的循环是可行的,但它可以在一步中更快地完成,为此有 numpy.einsum
:
b = np.einsum('ijk,ik->ij', m[:,:n,:n], p-m[:,n,:])
现在,v
包含每个单纯形的顶点索引,w
包含相应的权重。要在点集 p
处获取内插值 p_values
,我们这样做(注意:为此,values
必须是 NumPy 数组):
values = np.array(values)
for i in range(len(p)): p_values[i] = np.inner(values[v[i]], w[i])
或者我们可以再次使用 `np.einsum' 一步完成:
p_values = np.einsum('ij,ij->i', values[v], w)
在某些插值点位于网格之外的情况下必须小心。在这种情况下,find_simplex(p)
为这些点返回 -1
,然后您将不得不屏蔽它们(可能使用 masked arrays)。
关于python - 使用 Delaunay 三角剖分 (n-dim) 进行插值,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/30373912/
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