python - 无法使用 distutils 构建 Cython 模块

Question

我正在尝试构建 Cython 以通过尝试将 cython 与 C header 链接来尝试从 python 调用 C 函数。当我尝试使用此命令构建 python 时

python setup.py build_ext --inplace

它显示了这个错误:

running build_extbuilding 'cython' extension/usr/bin/clang -fno-strict-aliasing -fno-common -dynamic -arch i386 -arch x86_64 -g -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -I/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/include/python2.7 -c cython.c -o build/temp.macosx-10.6-intel-2.7/cython.ocython.c:692:14: error: typedef redefinition with different types ('void' vs      'struct _typeobject')typedef void PyTypeObject;             ^/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/include/python2.7/object.h:411:3: note:       previous definition is here} PyTypeObject;  ^1 error generated.error: command '/usr/bin/clang' failed with exit status 1

编辑:我的 cython.pyx 看起来像这样:

cdef extern from "rnafoldenergy.h":    float dostuff(int maxw, char *sequence2, char *sequence3, float *freeenergy)cpdef int dothings():    print "Hello!"    cdef int maxw = 50    cdef float freeenergyarray[3]    freeenergyarray[:] = [0, 0, 0]    cdef char* sequence2 = "AAACATTGAAAATAAGAGTACATGAAGGATATGAGGAATTCACAATGGTTGGGCGAAGAGCAACAGCCATTCTAAGGAAAGCAACCAGAAGACTGATCCAACTGATAGTGAGTGGGAAAG"    cdef char* sequence3 = "ATCCTTCATGTACTCTTATTTTCAATGTTTATAAAAGAGGAGAAATATAAAATGTGAAAATAAAACCTGGCGGCAGCGCAAAAG"    cdef float interactenergy=0    interactenergy=dostuff(maxw=maxw, sequence2=sequence2, sequence3=sequence3, freeenergy=freeenergyarray)    print "A: %f, B: %f, AB: %f, Interact: %f" % (freeenergyarray[0],freeenergyarray[1],freeenergyarray[2],interactenergy)    return 0

Answer 1

我认为这是因为您将文件称为“cython.pyx”。我可以使用名为“cython.pyx”的文件重现您的错误，但如果我将其重命名为其他名称，则我不会收到 typedef void PyTypeObject; 行，因此不会收到错误。

为什么这会产生那个确切的错误有点神秘，但鉴于已经有一个名为“cython”的模块(您正在使用...)，最好不要将您的模块称为相同的东西。