python - 字符串转换器程序不工作

Question

我正在尝试制作一个基本程序，将字符串 ATGTACATGGGCATAGCCATATA 转换为其 RNA 序列，即 UACAUGUACCCGUAUCGGUAUAU。

但输出是:CCCCCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUU

但它不是很有效。我认为问题在于它会逐一遍历整个字符串。

我是生物信息学编程的新手，所以欢迎任何建议。

DNA = "ATGTACATGGGCATAGCCATATA"
dna_length = len(DNA)

print("DNA: " + DNA)
print()
print("Length of DNA in base pairs: "+ str(dna_length))

RNA = []
for char in DNA:
    if char == "G":
        RNA.append("C")
for line in DNA:
    if char == "C":
        RNA.append("G")
for line in DNA:
    if char == "A":
        RNA.append("U")
for line in DNA:
    if char == "T":
        RNA.append("A")

print("".join(RNA))

Answer 1

我会使用 dict 来执行您的替换，然后在 join 中使用生成器表达式来执行您的翻译。

>>> RNA = {'G':'C', 'C':'G', 'A':'U', 'T':'A'}
>>> DNA = 'ATGTACATGGGCATAGCCATATA'
>>> translated = ''.join(RNA[i] for i in DNA)
>>> translated
'UACAUGUACCCGUAUCGGUAUAU'