python - 用 python 解析 xml - 根据祖 parent 的 sibling 选择 child

Question

我正在尝试使用 ElementTree 来解析 xml 文件。鉴于下面的 xml，我需要写入文件“chain_id”(在标题“m”下)和“名称”(在标题“r”下)，但前提是满足以下条件:1.)“css”(在标题“i”下)不是 -0，并且 2.)“bsa”> 0

当满足第二个条件时，我可以跟踪“名称”:

for r in root.iter('r'):
        name = r.find('name').text
        bsa = r.find('bsa').text
        if eval(bsa) > 0:
            print name

但我最终得到了很多我不需要的名字，因为我无法弄清楚如何根据第一个标准来确定这个条件。我研究了 Xpath，但我很难实现它。

总而言之，如果“m”(“css”)的 sibling 具有一定的值(value)，我只对“m”的 child 和曾孙感兴趣。

xml 文件相当大，有 > 20 个“i”，每个“i”至少有两个“m”，每个“m”有 >100 个“r”。

我更愿意使用标准的 python 方法(不是 lxml 或漂亮的石头汤)

<pi>
  <pe>
    <ni>20</ni>
    <i>
      <id>1</id>
      <css>-0</css>
      <m>
        <id>1</id>
        <chain_id>B</chain_id>
        <int_nres>19</int_nres>
        <rs>
          <r>
            <ser_no>1</ser_no>
            <name>MET</name>
            <seq_num>0</seq_num>
            <asa>157.15526405</asa>
            <bsa>0</bsa>
          </r>
          <r>
           .
           .
           .            
          </r>  
      <m>
        .
        .
        .
      </m>
    </i>
    <i>
      .
      .
      .
    </i>
  </pe>
</pi>

Answer 1

myxml=ET.parse('path_to_yourxml')
for elem in myxml.getroot().findall('pi/pe/i'):
    if elem.find('css').text!='-0':
        for elem1 in elem.findall('m'):
            if eval(elem1.find('rs/r/bsa').text)>0:
                print elem1.find('rs/r/name').text