python - biopython 的 efetch 只返回任何数据库的第一个特征

Question

知道为什么这段代码:

handle = Entrez.efetch(db="nuccore", 
         id=['556503834'], rettype="gb", 
         retmode="txt")
print(handle.read())

不返回找到的完整功能 on the ncbi description ？仅返回第一个特征(我的目标是获取 CDS 特征)。

我尝试了其他数据库得出相同的结论。

Answer 1

将 rettype 更改为 "gbwithparts"

from Bio import Entrez
Entrez.email = "your@mail.com" #put real mail

handle = Entrez.efetch(db="nuccore", id=['556503834'], 
                   rettype="gbwithparts", retmode="txt")
print(handle.read())

注意:可能需要几秒钟