python - 将 Pandas 数据框中的每一行复制到单个文件

Question

我一直在尝试将 data.frame 的每一行保存在一个名为该特定行的索引的文件中。

data.frame 的结构基本上是这样的:

SUBMITTED_ID    SYMBOL  IMMUNE  CLASS   CELL_HUM    LOCATION_ARM    LOCATION_MIN    LOCATION_MAX
FBgn0000047  Act88F     control control control 3R  15439969    15442177
FBgn0000094  Anp    immunity    humoral AMP 3R  30209948    30210382
FBgn0000116  Argk   control control control 3L  9048781 9066027

到目前为止我得到的是:

import sys
import pandas as pd
import numpy as np

df = pd.read_csv(sys.argv[1])
df['NAME']= df['SUBMITTED_ID']+'-'+df['SYMBOL']+'-'+df['IMMUNE']+'-'+df['CLASS']+'-'+df['CELL_HUM']
df_indexed = df.set_index('NAME')
df_bed =df_indexed[['LOCATION_ARM','LOCATION_MIN','LOCATION_MAX']]
for index, row in df_bed.iterrows():
    np.savetxt(str(index)+'.bed', row, delimiter='\t', fmt="%s")

它可以工作，但是它将行中的每个值保存在单独的行中，如下所示:

3R
22034298
22038925

有人知道我在这里做错了什么吗？

谢谢，

穆里略

Answer 1

如果需要索引，先reset_index , 通过 values 转换为 ndarray然后使用 tofile :

for row in df_bed.reset_index().values:
    #print row
    row[1:].tofile(str(row[0])+'.bed', sep="\t", format="%s")