python - 在 Python 2.7 中使用 Ruffus 库，just_print 标志失败

Question

我在 Python 2.7 中有一个 ruffus 管道，但是当我用 -n 或 --just_print 调用它时，它仍然运行所有实际任务，而不仅仅是像预期的那样打印管道。我:
* 没有 -n 参数会取代内置参数(尽管我有其他命令行参数)
* 有一堆带有 @transform() 或 @merge() 装饰器的函数
* 使用 run_pipeline() 调用结束管道

有没有人遇到过这个问题？非常感谢!

Answer 1

从 ruffus 2.4 版开始，您可以使用内置的 ruffus.cmdline它通过使用 argparse 的 cmdline.py 模块存储适当的标志，例如:

from ruffus import *
parser = cmdline.get_argparse(description='Example pipeline')
options = parser.parse_args()

@originate("test_out.txt")
def run_testFunction(output):
        with open(output,"w") as f:
            f.write("it's working!\n")

cmdline.run(options)

然后使用如下命令从终端运行您的管道:

python script.py --verbose 6 --target_tasks run_testFunction --just_print

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如果您想手动执行此操作(这对于旧版本的 ruffus 是必需的)，您可以调用 pipeline_printout()而不是 pipeline_run() ，使用 argparse 以便 --just_print 标志导致适当的调用，例如:

from ruffus import *
import argparse
import sys

parser = argparse.ArgumentParser(description='Example pipeline')
parser.add_argument('--just_print', dest='feature', action='store_true')
parser.set_defaults(feature=False)
args = parser.parse_args()

@originate("test_out.txt")
def run_testFunction(output):
        with open(output,"w") as f:
            f.write("it's working!\n")

if args.feature:
    pipeline_printout(sys.stdout, run_testFunction, verbose = 6)
else:
    pipeline_run(run_testFunction, verbose = 6)

然后您将运行如下命令:

python script.py --just_print