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linux - 在 Linux 中比较文本文件中两列的特定部分

转载 作者:太空宇宙 更新时间:2023-11-04 05:07:49 25 4
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我有一个文本文件,其中包含由制表符分隔的几列,如下所示:


1 ATGCCCAGA AS:i:10 XS:i:10
2 ATGCTTGA AS:i:10 XS:i:5
3 ATGGGGGA AS:i:10 XS:i:1
4 ATCCCCGA AS:i:20 XS:i:20

我现在想要比较最后两列 AS:i:(n1) 和 XS:i:(n2) 以仅获取 n1 与 n2 不同的行。所以,我想要的输出是:

    2    ATGCTTGA   AS:i:10   XS:i:5  
3 ATGGGGGA AS:i:10 XS:i:1

你能建议我一些比较 n1 和 n2 并打印输出的方法吗?提前致谢。

最佳答案

正如 Shawn 所说,您可以使用 awk...或 perl...或 sed 来完成此操作。

AWK 示例可能是

awk '{split($3,a,":");split($4,b,":");if(a[3]!=b[3]) print $0}' infile.txt

如果您熟悉 awk,这应该是相当不言自明的

关于linux - 在 Linux 中比较文本文件中两列的特定部分,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/59027111/

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