python - RKeras "unknown url type: https"错误 six.urlretrieve(来自 R 的 Python 代码)

Question

TL;DR :-) 获取 https url 在 python 和 R 中都有效，但当 python 代码从 R 运行时则无效。

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在运行 RKeras 包文档中的一些代码时，我多次遇到 fatal error :"unknown url type: https" 问题起源于用 Python 实现的 Keras。

我深入研究了这个问题，发现这是在 Keras 调用模块 six 中的函数 urlretrieve 以从 https url 检索数据时发生的。

然后我在 iPython 中测试了代码，发现它运行良好。

<!-- language: lang-python -->
from six.moves.urllib.request import urlretrieve
urlretrieve(url="https://www.google.com")

然后我尝试在 R 中做同样的事情但失败了

<!-- language: lang-r -->
library(reticulate)
py_run_string('from six.moves.urllib.request import urlretrieve')
py_run_string("urlretrieve(url='https://www.google.com')")

但是，同样的事情在 R 中使用纯 http

<!-- language:lang-r -->
py_run_string("urlretrieve(url='http://www.google.com')")

郑重声明，https 在我的 R 中使用 httr 等包工作正常。

我在这里完全超出了我的深度。会发生什么？

这是关于我的环境的一些输出

回复:

sessionInfo()
# R version 3.4.4 (2018-03-15)
# Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
# Running under: Ubuntu 16.04.4 LTS
# other attached packages:
# [1] reticulate_1.6 kerasR_0.8.0  

和 Python(从 R 看)

py_config()

version:        3.5.2 |Anaconda custom (64-bit)| 
(default, Jul  2 2016, 17:53:06)  [GCC 4.4.7 20120313 (Red Hat 4.4.7-1)]

非常感谢您的时间和精力。

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编辑:R 中的更多调试信息:

py_run_string("from OpenSSL import SSL")
# ImportError: /xxx/python3.5/lib-dynload/_ssl.so: undefined symbol: SSLv2_method

Answer 1

目前，我发布了针对我的特定问题的部分解决方案。这不会解决 Reticulate 和 SSL 的一般问题，但它是一个不错的临时解决方法，可以帮助任何使用KerasR 或 Keras 并发现它无法下载模型和数据库的人强>

Keras/KerasR 使用缓存来避免将来下载同一对象。在我的例子中，它是 ~/.keras/

于是从控制台复制下载失败的URL，用浏览器下载对象并保存到keras的缓存目录。

cache for models : ~/.keras/models/
cache for datasets : ~/.keras/datasets/
(where ~ is my home directory)

当然，这是一种解决方法，我仍然期待有人发布适用于系统范围的正确解决方案。