python - 安装包时出现 UnsatisfiableError

Question

我正在尝试使用以下命令在 Mac 终端上安装 pairtools ( https://github.com/mirnylab/pairtools) 包:

conda install -c conda-forge -c bioconda pairtools

当我运行它时，我收到以下错误消息:

Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: failed
Collecting package metadata (repodata.json): done
Solving environment: failed

UnsatisfiableError: The following specifications were found to be incompatible with each other:

  - pip -> python[version='>=3.6,<3.7.0a0']

这是版本问题吗？我当前的 python 版本是 3.7.3。我该如何纠正这个问题？任何帮助将不胜感激。谢谢!

我在运行上述命令之前更新了包:conda update anaconda 和 conda update --all

Answer 1

为避免在使用 conda 时出现此类依赖冲突，请创建一个新环境，其中仅包含您选择的包:

conda create -n newenvname -c channelname package1 package2

创建一个名为 newenvname 的环境，其中包含 package1、package2 及其依赖项，并搜索 channel channelname作为默认 channel (省略 -c channelname 以仅使用默认值)。如需更多帮助，请键入 conda create --help。如果您想在此环境中使用 Spyder IDE，请不要忘记包含 spyder-kernels 包。

我实际上建议始终保持基本的 conda 环境不变，并创建一个或多个工作环境，您可以将其安装或升级到您想要的内容，安全知道在最坏的情况下，您可以简单地删除该环境并重新创建它，而不会弄乱您的 Anaconda 安装。