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python - 在不是来自 pymc 的样本上使用 pymc 诊断和后验总结

转载 作者:太空宇宙 更新时间:2023-11-04 03:54:35 27 4
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我想对我在不使用 pymc 的情况下生成的示例使用 pymc 诊断和摘要功能。例如,我想在我自己的一组示例中使用 pymc 的 mc_error 例程。

一些 pymc 诊断函数可以采用 np.array 样本,但是,如果我理解正确的话,其他函数似乎需要一个跟踪对象。如何将我自己的样本集转换为 pymc 可以处理的跟踪对象?如有任何指点,我将不胜感激。

我的样本目前存储为字典,其中每个键都是我正在采样的变量的名称,并指向样本的 np.array。

谢谢!

最佳答案

您是在谈论 batchsd 函数吗?这就是 PyMC 2 中用于计算 MC 错误的内容。它位于 pymc.database.base 模块中,实际上可以用于任何数组。

pymc.diagnostics 模块包含所有收敛诊断函数,应该可以在 numpy 数组上工作。

关于python - 在不是来自 pymc 的样本上使用 pymc 诊断和后验总结,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/19577144/

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