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我有大量的源代码,其中大部分是用 Fortran90 语言编写的,但有些部分是用 C 语言编写的。为了正确编译此代码需要安装 MPI 和 HDF5。当我尝试编译模型时,我现在已经安装了它们(编译不是使用 ./compile
命令而是使用 ./install.sh
并且它会处理所有事情,包括汇编)。我有一个很长的错误,并且都与头文件的路径有关。这是错误:
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: mpif.h
Can't find file: stdio.h
Can't find file: math.h
Can't find file: stdlib.h
Can't find file: malloc/malloc.h
Can't find file: malloc.h
Can't find file: stdlib.h
Can't find file: errno.h
Can't find file: string.h
Can't find file: ctype.h
Can't find file: dirent.h
Can't find file: string.h
之后还有一些其他错误,我认为它们与上述错误有关。我试图在 ./bashrc 中设置 PATH,当我搜索例如 locate mpif.h 时,它返回:
[hamid@localhost bin]$ locate mpif.h
/home/hamid/Downloads/ED-2.1/ED/build/bin/mpif.h
/home/hamid/Downloads/ED-2.1/ED/src/mpi/mpif.h
/home/hamid/Downloads/mpich-3.1.3/src/binding/fortran/mpif_h/mpif.h
/home/hamid/Downloads/mpich-3.1.3/src/binding/fortran/mpif_h/mpif.h.in
/home/hamid/Downloads/mpich-3.1.3/src/include/mpif.h
/home/hamid/mpich2-optimised/include/mpif.h
我还设置了 LD_LIBRARY_PATH 变量,如:
export LD_LIBRARY_PATH=$MPI_DIR/lib:$LD_LIBRARY_PATH
但它似乎仍然不起作用。我的猜测是它不仅与 MPI 或 HDF 路径设置有关,因为其中一些是 GCC(C 编译器)头文件。知道可能是什么问题吗?
最佳答案
正如评论所说,您可以使用-I
指定目录,然后编译器会在那里找到.h
文件。例如:
gfortran -o name.o -c -I/usr/lib/openmpi/include name.f90
如果您正在使用 ifort
,另一种方法是将目录附加到 FPATH
,也许:
FPATH=$FPATH:usr/lib/openmpi/include
虽然这不适用于 gfortran。我不知道其他编译器。
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