linux - GPU 的 LAMMPS 错误 -/usr/bin/ld : cannot find -lmpi_stubs while making using make command

Question

我正在尝试在 GPU 中安装 LAMMPS。按照http://lammps.sandia.gov/doc/accelerate_gpu.html中给出的步骤进行操作后，我已经完成了步骤(a)并获得了文件 - libgpu.a 和 Makefile.lammps。

当我尝试继续第二步(在 make yes-gpu 之后进行串行)时，我收到一条错误消息 - /usr/bin/ld: 找不到 -lmpi_stubs。

Answer 1

错误消息表明链接器无法找到构建所需的 MPI 库。通常，make serial 会在没有 MPI 支持的情况下构建 lammp。来自 make help (在 lammps/src 目录中调用):

# serial = RedHat Linux box, g++4, no MPI, no FFTs

但是，Lammps GPU 包需要 MPI。因此，

1. 确保您已安装必要的 MPI 库。
2. 使用以下命令之一构建 lammp(有关更多选项，请参阅 make help):
   1. make g++(编译器:g++4，MPI 实现:MPICH2)
   2. make g++3(编译器:g++3，MPI 实现:MPICH2)
   3. make linux(编译器:icc，MPI 实现:MPICH2)
   4. make openmpi(编译器:mpic++，MPI 实现:OpenMPI-1.1)