linux - GNU GMP 和 Matlab mex 在 Linux 下不协作

Question

我正在安装有 Matlab R2015a 的 64 位 Ubuntu 14.04.3 计算机上工作。海湾合作委员会是:

gcc version 4.7.3 (Ubuntu/Linaro 4.7.3-12ubuntu1) 

Matlab 的 mex 也配置为完全使用此编译器。现在，我想使用 GNU GMP 任意精度算术库。我下载了当前版本6.0.0并安装了它:

./configure
make
make check
sudo make install

一切正常；结果我得到“gmp.h”和“libgmp.a”。我还可以编写一个小型 native C 程序来演示 GNU GMP 库的工作原理:

#include <stdio.h>
#include "gmp.h"
int main() {
    mpz_t integ; /* Initialize the GMP variable */
    mpz_init(integ); /* Initialize the GMP variable */
    mpz_set_si(integ, 10); /* Assign a value */
    int test = (int)mpz_get_si(integ); /* Read the value into an int */
    printf("test = %.1f\n",(double)test); /*Print it */
return 0;
}

该程序编译并使用

gcc Test.c libgmp.a

正如预期的那样(libgmp.a 和 gmp.h 位于同一目录中)。

但是，我现在想要创建一个可以使用 Matlab 的 mex 编译器进行编译的 C 程序(该程序稍后应与 Matlab 接口(interface))。以下是上面的改编版最小示例，将使用 Matlab 的 mex 进行编译:

#include <stdio.h>
#include "mex.h"
#include "gmp.h"
void mexFunction( int nlhs, mxArray *plhs[],
    int nrhs, const mxArray *prhs[])
{
    mpz_t integ; /* Initialize the GMP variable */
    mpz_init(integ); /* Initialize the GMP variable */
    mpz_set_si(integ, 10); /* Assign a value */
    int test = (int)mpz_get_si(integ); /* Read the value into an int */
    mexPrintf("test = %.1f\n",(double)test); /*Print it */
}

同样，libgmp.a 和 gmp.h 位于工作目录中。我现在尝试使用 Matlab 的 mex 编译这个程序:

mex MatlabTest.c libgmp.a

但是，我收到此错误:

Error using mex
/usr/bin/ld: libgmp.a(realloc.o): relocation R_X86_64_32 against `.rodata.str1.1' can not be used when making a shared object; recompile with -fPIC
libgmp.a: error adding symbols: Bad value
collect2: error: ld returned 1 exit status

请记住，两个编译器是相同的。我确实使用 -fpic 标志重新编译了 GMP 库，一旦打开 -fPIcflags，两次我都从 Matlab 得到相同的错误。

Matlab 的构建输出(mex 中的 -v 选项)是:

CXX="g++"
CFLAGS="-ansi -fexceptions -fPIC -fno-omit-frame-pointer -pthread -DMX_COMPAT_32   -D_GNU_SOURCE -DMATLAB_MEX_FILE "
CXXFLAGS="-ansi -fexceptions -fPIC -fno-omit-frame-pointer -pthread -DMX_COMPAT_32   -D_GNU_SOURCE -DMATLAB_MEX_FILE "
COPTIMFLAGS="-O -DNDEBUG"
CXXOPTIMFLAGS="-O -DNDEBUG"
CDEBUGFLAGS="-g"
CXXDEBUGFLAGS="-g"
LD="/usr/bin/gcc"
LDXX="g++"
LDFLAGS="-pthread -Wl,--no-undefined -Wl,-rpath-link,/usr/local/MATLAB/R2015a/bin/glnxa64 -shared  libgmp.a  -L"/usr/local/MATLAB/R2015a/bin/glnxa64" -lmx -lmex -lmat -lm -lstdc++ -Wl,--version-script,"/usr/local/MATLAB/R2015a/extern/lib/glnxa64/mexFunction.map""
LDDEBUGFLAGS="-g"
GCC : /usr/bin/gcc
CPPLIBS : /usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.7/libstdc++.so
MATLABROOT : /usr/local/MATLAB/R2015a
ARCH : glnxa64
SRC : /home/mario/GMPtest/Matlab-Test/MatlabTest.c
OBJ : /tmp/mex_52646937964974_11644/MatlabTest.o
OBJS : /tmp/mex_52646937964974_11644/MatlabTest.o 
SRCROOT : /home/mario/GMPtest/Matlab-Test/MatlabTest
DEF : /tmp/mex_52646937964974_11644/MatlabTest.def
EXP : MatlabTest.exp
LIB : MatlabTest.lib
EXE : MatlabTest.mexa64
ILK : MatlabTest.ilk
MANIFEST : MatlabTest.mexa64.manifest
TEMPNAME : MatlabTest
EXEDIR : 
EXENAME : MatlabTest
OPTIM : -O -DNDEBUG
LINKOPTIM : -O
-------------------------------------------------------------------
Building with 'gcc'.
/usr/bin/gcc -c -DMX_COMPAT_32   -D_GNU_SOURCE -DMATLAB_MEX_FILE  -I"/usr/local/MATLAB/R2015a/extern/include" -I"/usr/local/MATLAB/R2015a/simulink/include" -ansi -fexceptions -fPIC -fno-omit-frame-pointer -pthread -O -DNDEBUG /home/mario/GMPtest/Matlab-Test/MatlabTest.c -o /tmp/mex_52646937964974_11644/MatlabTest.o
/usr/bin/gcc -pthread -Wl,--no-undefined -Wl,-rpath-link,/usr/local/MATLAB/R2015a/bin/glnxa64 -shared  -O -Wl,--version-script,"/usr/local/MATLAB/R2015a/extern/lib/glnxa64/mexFunction.map" /tmp/mex_52646937964974_11644/MatlabTest.o   libgmp.a  -L"/usr/local/MATLAB/R2015a/bin/glnxa64" -lmx -lmex -lmat -lm -lstdc++ -o MatlabTest.mexa64

尽管底层编译器是相同的，但为什么它不能用 matlab 的 mex 编译，有什么想法吗？

非常感谢! - 马里奥

Answer 1

啊，就是这样 - 我必须编译 GMP 库来生成共享库:

/configure --enable-shared --disable-static

然后，我获得 GMP 库 libgmp.so(以及 libgmp.so.10、libgmp.so.10.2.0)，然后可以使用它来使用 mex 编译 C 文件:

mex MatlabTest.c libgmp.so

感谢您的提示!