Python正则表达式模块模糊匹配: substitution count not as expected

Question

背景

Python 模块 regex允许模糊匹配。

您可以指定允许的替换数 (s)、插入数 (i)、删除数 (d) 和总错误数 (e)。

匹配结果的 fuzzy_counts 属性返回一个元组 (0,0,0)，其中:

match.fuzzy_counts[0] = count for 's' 
match.fuzzy_counts[1] = count for 'i' 
match.fuzzy_counts[2] = count for 'd'

问题

删除和插入按预期计算，但不计算替换。

在下面的示例中，唯一的变化是查询中删除了一个字符，但替换计数为 6(如果删除 BESTMATCH 选项则为 7)。

如何计算替换数？

如果有人能向我解释这是如何工作的，我将不胜感激。

>>> import regex
>>> reference = "(TATGGGA[CT][GC]AAAG[CT]CT[AC]AA[GA]CCATGTG){s<7,i<3,d<3,e<8}"
>>> query = "TATGGACCAAAGTCTCAAGCCATGTG" 
>>> match = regex.search(reference, query, regex.BESTMATCH)
>>> print(match.fuzzy_counts)
(6,0,1)

Answer 1

这个问题似乎与允许的错误设置中的值有关。

将 s 减少到 s < 3 会向下更改模糊匹配元组得分:

>>> reference = "(TATGGGA[CT][GC]AAAG[CT]CT[AC]AA[GA]CCATGTG){s<3,i<3,d<3,e<4}" 
>>> query = "TATGGACCAAAGTCTCAAGCCATGTG"  
>>> match = regex.search(reference, query, regex.BESTMATCH)
>>> print(match.fuzzy_counts) 
(1,0,1)

进一步减少 's' 的允许错误会返回此匹配项的预期 's' 分数:

>>> reference = "(TATGGGA[CT][GC]AAAG[CT]CT[AC]AA[GA]CCATGTG){s<2,i<3,d<3,e<4}"
>>> query = "TATGGACCAAAGTCTCAAGCCATGTG" 
>>> match = regex.search(reference, query, regex.BESTMATCH)
>>> print(match.fuzzy_counts)
(0,0,1)

为什么它会这样，对我来说仍然是个谜。