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前提:许多等级需要向其他等级发送数据。其他排名是
1) 通常是整个通信器大小的一小部分
2) 接收者不知道
因此,接收者不知道他们将收到多少消息或从何处接收。
一种可能的解决方案如下
Isend all messages
Busy wait
Probe & Recv messages
When all Isends complete
start IBarrier
exit when IBarrier completes
通过让每个等级在其自己的 Isends 完成时到达屏障,屏障在所有等级上的出站消息“在空中”时结束
问题:MPI 3.1 标准的第 3.7.3 节指出,使用 MPI_Test 或 MPI_Wait 完成发送并不意味着相应的操作已经完成,而只是缓冲区可以自由重用。
这显然会导致一个竞争条件,即有一个挂起的 Isend 没有对应的 Irecv。接收级别不再监听,因为在消息可以与 Irecv 匹配之前达到 IBarrier。
最佳答案
从您暴露问题的方式来看,在我看来一开始没有同步问题。因此,这是我提出的解决方案:
int sendSizes[size]; // size of the messages I'll send to each process
// Populate sendSizes here
/* ........ */
int recvSizes[size]; // size of the messages I'll receive from each process
MPI_Alltoall( sendSizes, 1, MPI_INT, recvSizes, 1, MPI_INT, MPI_COMM_WORLD );
// Now I know exactly what to expect from each process
// I could use a Irecv - Isend - Waitall approach
// but a MPI_Alltoallv might be more appropriated
int sendDispls[size], recvDispls[size];
sendDispls[0] = recvDispls[0] = 0;
for ( int i = 0; i < size - 1; i++ ) {
sendDispls[i+1] = sendDispls[i] + sendSizes[i];
recvDispls[i+1] = recvDispls[i] + recvSizes[i];
}
int fullSendSize = sendDispls[size-1] + sendSizes[size-1];
double sendBuff[fullSendSize];
// Populate the sending buffer here
/* ........ */
int fullRecvSize = recvDispls[size-1] + recvSizes[size-1];
double recvBuff[fullRecvSize];
MPI_Alltoallv( sendBuff, sendSizes, sendDispls, MPI_DOUBLE,
recvBuff, recvSizes, recvDispls, MPI_DOUBLE,
MPI_COMM_WORLD );
如您所见,解决方案的基石是首先调用 MPI_Alltoall()
让每个进程知道对其他进程的期望。这种全局通信在进程同步方面应该不是问题,因为所有进程都应该在开始时同步。
一旦完成,最初的问题就变得微不足道了。它可以通过使用 MPI_Irecv()
循环,然后是 MPI_Isend()
循环和最后的 MPI_Waitall()
来解决。然而,我宁愿在这里调用 MPI_Alltoallv()
来做同样的事情,只是为了证明它也是可能的。简而言之,在现实生活中,发送和接收缓冲区可能已经存在,只需要计算位移以指向正确的位置,从而避免不必要的数据拷贝。
但同样,这部分现在很简单,因此您可以自行决定在您的代码上下文中什么是最好的。
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