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谁能提出一个好的解决方案来从数据框中删除反向重复项?
我的数据看起来像这样,其中第一列和第二列是颠倒的重复项。
TRINITY_DN16813_c0_g1_i3 TRINITY_DN16813_c0_g1_i4 96.491 228 8 0 202 429 417 190 3.049999999999999e-104 377
TRINITY_DN16813_c0_g1_i4 TRINITY_DN16813_c0_g1_i3 96.104 231 9 0 190 420 429 199 2.979999999999999e-104 377
我只需要保留一行,其中第三列具有较高的值
TRINITY_DN16813_c0_g1_i3 TRINITY_DN16813_c0_g1_i4 96.491 228 8 0 202 429 417 190 3.049999999999999e-104 377
这是我使用 series.isin() 时的结果。
TRINITY_DN28139_c0_g1_i2 TRINITY_DN28139_c0_g1_i5 99.971 3465 1 0 1 3465 1 3465 0.0 6394
TRINITY_DN28139_c0_g1_i5 TRINITY_DN28139_c0_g1_i2 99.971 3465 1 0 1 3465 1 3465 0.0 6394
TRINITY_DN25313_c0_g1_i6 TRINITY_DN25313_c0_g1_i5 99.97 3315 1 0 1 3315 1 3315 0.0 6117
TRINITY_DN25313_c0_g1_i5 TRINITY_DN25313_c0_g1_i6 99.97 3315 1 0 1 3315 1 3315 0.0 6117
TRINITY_DN25502_c0_g1_i3 TRINITY_DN25502_c0_g1_i4 99.96799999999999 3078 1 0 1 3078 1 3078 0.0 5679
TRINITY_DN25502_c0_g1_i4 TRINITY_DN25502_c0_g1_i3 99.96799999999999 3078 1 0 1 3078 1 3078 0.0 5679
TRINITY_DN28726_c0_g1_i2 TRINITY_DN28726_c0_g1_i1 99.96600000000001 5805 2 0 1 5805 1 5805 0.0 10709
TRINITY_DN28726_c0_g1_i1 TRINITY_DN28726_c0_g1_i2 99.96600000000001 5805 2 0 1 5805 1 5805 0.0 10709
TRINITY_DN27942_c0_g1_i7 TRINITY_DN27942_c0_g1_i6 99.964 2760 1 0 1 2760 1 2760 0.0 5092
TRINITY_DN25118_c0_g1_i1 TRINITY_DN25118_c0_g1_i2 99.964 2770 1 0 81 2850 204 2973 0.0 5110
TRINITY_DN27942_c0_g1_i6 TRINITY_DN27942_c0_g1_i7 99.964 2760 1 0 1 2760 1 2760 0.0 5092
TRINITY_DN25118_c0_g1_i2 TRINITY_DN25118_c0_g1_i1 99.964 2770 1 0 204 2973 81 2850 0.0 5110
TRINITY_DN28502_c1_g1_i9 TRINITY_DN28502_c1_g1_i7 99.963 2678 1 0 1928 4605 2021 4698 0.0 4940
TRINITY_DN28502_c1_g1_i7 TRINITY_DN28502_c1_g1_i9 99.963 2678 1 0 2021 4698 1928 4605 0.0 4940
TRINITY_DN25619_c0_g1_i1 TRINITY_DN25619_c0_g1_i8 99.963 2715 1 0 1 2715 1 2715 0.0 5009
TRINITY_DN25619_c0_g1_i8 TRINITY_DN25619_c0_g1_i1 99.963 2715 1 0 1 2715 1 2715 0.0 5009
TRINITY_DN23022_c0_g1_i5 TRINITY_DN23022_c0_g1_i1 99.962 2622 1 0 1 2622 1 2622 0.0 4837
最佳答案
试试这个。它完全在 Pandas 中(应该更快)这也纠正了我之前回答中的错误,但将标签作为一对的概念保持不变。
In [384]: df['pair'] = df[[0, 1]].apply(lambda x: '{}-{}'.format(*sorted((x[0], x[1]))), axis=1)
只获取每个重复结果的最大值:
In [385]: dfd = df.loc[df.groupby('pair')[2].idxmax()]
如果您需要将名称放在单独的列中:
In [398]: dfd[0] = dfd['pair'].transform(lambda x: x.split('-')[0])
In [399]: dfd[1] = dfd['pair'].transform(lambda x: x.split('-')[1])
关于python - 从数据框中删除反向重复项,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/54386718/
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