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我想创建一个能够将多个图形绘制到一个 PDF 文件中的 python 程序,但是子图的数量是可变的。我已经做到了,每页一个图。然而,因为我得到了 someteimes around 100 plots 这使得很多滚动并且没有真正清楚地显示。因此,我希望每页有 5X4 个子图。我已经为此编写了代码,整个代码很长,而且由于我是 pyhton 的新手,对于知道该怎么做的人来说它看起来很糟糕,但是绘图部分看起来像这样:
rows = (len(tags))/5
fig = plt.figure()
count = 0
for keyInTags in tags:
count = count + 1
ax = fig.add_subplot(int(rows), 5, count)
ax.set_title("cell" + keyInTags)
ax.plot(x, y_green, color='k')
ax.plot(x, y_red, color='k')
plt.subplots_adjust(hspace=0.5, wspace=0.3)
pdf.savefig(fig)
我的想法是我得到一个 PDF,其中绘制了所有“细胞”(用于生物学研究)。到目前为止,我编写的代码运行良好,但是如果我得到超过 4 行的子图,我想做一个“pageprake”。在某些情况下,我在一页上有超过 21 行,这使得我无法看到任何东西。
那么,是否有解决方案,例如,告诉 Python 在 4 行后进行分页?在 id 为 21 行的情况下,有 6 个页面有漂亮的可见图。还是通过绘制 5x4 图然后以某种方式遍历文件来完成?如果有人能提供一点帮助或提示,我会很高兴。我在这里坐了 4 个小时,没有找到解决方案。
最佳答案
您可以找出需要多少页 (npages
) 并为每页创建一个新图形。
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.backends.backend_pdf import PdfPages
tags = ["".join(np.random.choice(list("ABCDEFG123"), size=5)) for _ in range(53)]
N = len(tags) # number of subplots
nrows = 5 # number of rows per page
ncols = 4 # number of columns per page
# calculate number of pages needed
npages = N // (nrows*ncols)
if N % (nrows*ncols) > 0:
npages += 1
pdf = PdfPages('out2.pdf')
for page in range(npages):
fig = plt.figure(figsize=(8,11))
for i in range(min(nrows*ncols, N-page*(nrows*ncols))):
# Your plot here
count = page*ncols*nrows+i
ax = fig.add_subplot(nrows, ncols, i+1)
ax.set_title(f"{count} - {tags[count]}")
ax.plot(np.cumsum(np.random.randn(33)))
# end of plotting
fig.tight_layout()
pdf.savefig(fig)
pdf.close()
plt.show()
或者您也可以遍历标签本身并在需要时创建一个新图形:
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.backends.backend_pdf import PdfPages
tags = ["".join(np.random.choice(list("ABCDEFG123"), size=5)) for _ in range(53)]
nrows = 5 # number of rows per page
ncols = 4 # number of columns per page
pdf = PdfPages('out2.pdf')
for i, tag in enumerate(tags):
j = i % (nrows*ncols)
if j == 0:
fig = plt.figure(figsize=(8,11))
ax = fig.add_subplot(nrows, ncols,j+1)
ax.set_title(f"{i} - {tags[i]}")
ax.plot(np.cumsum(np.random.randn(33)))
# end of plotting
if j == (nrows*ncols)-1 or i == len(tags)-1:
fig.tight_layout()
pdf.savefig(fig)
pdf.close()
plt.show()
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