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我已经用 python 编写了一个运行正常的 Spark 程序。
但是,它在内存消耗方面效率低下,我正在尝试对其进行优化。我在 AWS EMR 上运行它,EMR 因消耗过多内存而终止了工作。
Lost executor 11 on ip-*****: Container killed by YARN for exceeding memory limits. 11.4 GB of 10.4 GB physical memory used. Consider boosting spark.yarn.executor.memoryOverhead.
我认为这个内存问题是由于我在几个实例中收集我的 RDD(即使用 .collect() ),因为在后期阶段,我需要测试由这些组成的列表中是否存在某些值是否为 RDD。
因此,目前我的代码如下所示:
myrdd = data.map(lambda word: (word,1)) \
.reduceByKey(lambda a,b: a+b) \
.filter(lambda (a, b): b >= 5) \
.map(lambda (a,b) : a) \
.collect()
稍后在代码中
if word in myrdd:
mylist.append(word)
myrdd2 = data2.map(lambda word: (word,1)) \
.reduceByKey(lambda a,b: a+b) \
.filter(lambda (a, b): b >= 5) \
.map(lambda (a,b) : a) \
.collect()
if word in myrdd2:
mylist2.append(word)
然后我多次重复这个模式。
有没有办法进行操作
if word in myrdd:
do something
不先收集 rdd?
有没有像rdd.contains()这样的函数?
P.S:我没有在内存中缓存任何东西。我的 Spark 上下文如下所示:
jobName = "wordcount"
sc = SparkContext(appName = jobName)
......
......
sc.stop()
最佳答案
来自 YARN 的错误消息说 collect
不是问题,因为您的执行程序(而不是驱动程序)有内存问题。
首先,尝试遵循错误消息建议并提升 spark.yarn.executor.memoryOverhead
- 在 YARN 上运行 pyspark 时,您可以告诉 YARN 为 python 工作进程内存分配更大的容器.
接下来,查看执行程序需要大量内存的操作。您使用 reduceByKey
,也许您可以增加分区的数量,使它们在使用的内存方面更小。查看 numPartitions
参数:http://spark.apache.org/docs/latest/api/python/pyspark.html#pyspark.RDD.reduceByKey
最后,如果你想检查 rdd 是否包含某个值,那么只需按该值过滤并使用 count
或 first
检查它,例如:
looking_for = "....."
contains = rdd.filter(lambda a: a == looking_for).count() > 0
关于python - 检查 RDD 中是否存在值,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/40797893/
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