python - conda 安装在 conda 中创建的 virtualenv 中不起作用

Question

我使用 conda 创建了一个 virtualenv，并在这个 env 下安装新的 python 包，如下所示。

conda create --name env_2
source activate env_2
conda install biopython

ls ~/anaconda/envs/env_2/lib/python3.6/site-packages/Bio/  # biopython is installed correctly

但是我还是不能用Bio。我错过了什么吗？

>>> import Bio
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
ImportError: No module named 'Bio'
>>>

Answer 1

默认情况下，conda create --name env_2 将仅安装 activate、deactivate 和 conda 包环境，将不会安装解释器:

$ ls miniconda3/envs/env_2/bin/
activate   conda      deactivate

如果你想安装 python 解释器，你有 3 个选项:

1. 提供 python 作为包安装在环境中:

   $ conda create --name env_2 python
   

2. 创建环境后将 python 作为包安装:

   $ source activate env_2
   (env_2)$ conda install python
   

3. 将 python 添加到默认包列表 ( documentation ):

   $ cat ~/.condarc
   create_default_packages:
     - python
   

编辑 1:

从评论中添加信息。