python - 带有结合了两个函数的 aggfunc 的数据透视表

Question

我想用结合了两个函数的 aggfunc 创建一个数据透视表。这个我试过了

 pivot=pd.pivot_table(data, columns='Genename', values=['Mediancoverage'],index='Componentnr', aggfunc=(np.median - np.std))

得到这个错误:

TypeError: unsupported operand type(s) for -: 'function' and 'function'

我明白问题所在，但解决方案是什么？

Answer 1

我认为您需要 lambda - 具有 pandas 函数的解决方案 median + std (需要更改 ddof=0，因为默认情况下 pandas 中的 ddof=1):

aggfunc=lambda x: x.median() - x.std(ddof=0)

什么是相同的:

aggfunc=lambda x: np.median(x) - np.std(x)

示例:

data = pd.DataFrame({
    'Genename' : ['a','a','b','b', 'b', 'b'],
    'Mediancoverage' : [4, 1, 5, 3, 7, 5],
    'Componentnr' : [1,2,1,2,1,2],        
    })
print (data)
   Componentnr Genename  Mediancoverage
0            1        a               4
1            2        a               1
2            1        b               5
3            2        b               3
4            1        b               7
5            2        b               5

---

pivot=pd.pivot_table(data, 
                     columns='Genename', 
                     values='Mediancoverage',
                     index='Componentnr',
                     aggfunc=lambda x: x.median() - x.std(ddof=0))

print (pivot)
Genename     a  b
Componentnr      
1            4  5
2            1  3

pivot=pd.pivot_table(data, 
                     columns='Genename', 
                     values='Mediancoverage',
                     index='Componentnr',
                     aggfunc=lambda x: np.median(x) - np.std(x))

print (pivot)
Genename     a  b
Componentnr      
1            4  5
2            1  3