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python - 为什么我的代码在每次运行后从相同图像中的相同列表中找到更多对象?

转载 作者:太空宇宙 更新时间:2023-11-04 00:05:43 24 4
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我写了一个代码,它查看一个预先存在的图像文件夹,并使用一个恒定的对象名称列表和它们在天空中相应的 ra、dec 位置来定位它们在每个原始图像中并制作一个 10x10 arcsec cutout (如果对象在图像中)。它正在工作,我得到了一些漂亮的 Papercut ,但出于某种奇怪的原因,每次我运行它时,都会保存新的 Papercut 图像!我真的不知道为什么会这样,因为对象列表及其 ra、dec 位置始终完全相同,而且我总是使用图像和对象的确切名称保存剪切图像,这些名称不应更改。所有原始图像也保持不变。

我已经进行了很多测试,但仍然感到困惑——通过我的测试,我已经确认对象列表 (objs) 在每次运行中保持相同,并且我得出了相同的结论原始图像列表 (all_images) 和 ra、dec 位置(列表 ras_hmsdecs_deg)。

原始图像和对象的数量都很长,所以我在较小的子集上运行我的代码进行测试,并且每次运行期间出现新的剪切图像的问题仍然存在。我在这些图像上运行了下面的代码:'calexp-HSC-I-18012-1,7.fits', 'calexp-HSC-I-18114-0,0.fits', 'calexp-HSC-I -18114-1,1.fits' 保存在目录 /Users/myuser/Desktop/Original_Images/ 中。我在另一个目录中运行我的代码,最后还保存了剪切图。第一次运行时,我生成了这些切口:'cutout-IMG-HSC-I-18114-0,0-OBJ-NEP175719.1+652743.2.fits',
'cutout-IMG-HSC-I-18114-1,1-OBJ-NEP175509.2+653523.9.fits'
。几分钟后,当我在不做任何更改的情况下运行完全相同的代码时,我还生成了这两个新图像:'cutout-IMG-HSC-I-18114-0,0-OBJ-NEP175654.7+652930.2.fits ',
'cutout-IMG-HSC-I-18114-1,1-OBJ-NEP175458.4+653419.1.fits'
,以此类推以供将来运行。

如您所见,它一定没有在我的一张图像中找到任何对象(这很好),但每次运行它都会以某种方式在其他每个图像中找到一个新对象(实际上,每次我运行这个在这个小子集上的代码我看到保存了两个新的剪切图像,具有不同的对象名称)。我很难过,因为就像我说的那样,它搜索的对象和坐标在每次运行的每个图像中都是相同的。任何见解或猜测将不胜感激!

import astropy
from astropy.nddata.utils import Cutout2D, NoOverlapError
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from astropy import units as u
from astropy.io import fits
from astropy.wcs import WCS
from astropy.coordinates import SkyCoord, Angle
import re
import glob

def make_cutouts(img_file, box_len):
# Image data
hdulist = fits.open(img_file)
img_data = fits.getdata(img_file)
img_name = re.search(r'calexp\-(.+)\.fits', img_file)[1]

# Make cutouts (by locating coords in image with WCS)
wcs = WCS(hdulist[1].header)
for i in range(len(objs)):
# Skip if cutout already exists
if 'cutout-IMG-'+img_name+'-OBJ-'+objs[i]+'.fits' in glob.glob('cutout*.fits'):
print('Cutout of object already exists for this image, skipping...')
continue

# Convert ra, dec to HMS for specific object
ra_h = re.search(r'h=(\d+.?\d*)', str(ras_hms[i]))[1]
ra_m = re.search(r'm=(\d+.?\d*)', str(ras_hms[i]))[1]
ra_s = re.search(r's=(\d+.?\d*)', str(ras_hms[i]))[1]
ra_angle = Angle((float(ra_h), float(ra_m), float(ra_s)), unit='hourangle')
dec_angle = decs_deg[i]

# Coordinate transformation to pixels
center = SkyCoord(ra_angle, dec_angle, frame='fk5')
xp, yp = astropy.wcs.utils.skycoord_to_pixel(center, wcs=wcs, origin=1)

# Make cutout, skip when object is not in image
size = u.Quantity((box_len,box_len),u.arcsec)
try:
co = Cutout2D(img_data,(xp, yp),size,wcs=wcs)
except NoOverlapError:
continue
hdu = fits.PrimaryHDU(data=co.data,header=co.wcs.to_header())
hdu.writeto('cutout-IMG-'+img_name+'-OBJ-'+objs[i]+'.fits', overwrite=True)
return


# Gather all original images

all_images = glob.glob('/Users/myuser/Desktop/Original_Images/calexp*.fits')
coords_file = 'good_dataset.fits'

# Coordinates

hdul = fits.open(coords_file)
coords_data = hdul[1].data
objs = coords_data['Name']
ras = np.array(coords_data['RA']) # in decimal degrees
decs = np.array(coords_data['DEC']) # in decimal degrees
# Convert coordinate systems using astropy
decs_deg = Angle(decs, unit=u.deg)
ras_deg = Angle(ras, unit=u.deg)
ras_hms = [ra.hms for ra in ras_deg]

count=0
for image in all_images:
make_cutouts(image, 10.0)
count+=1
print('Image %d out of %d completed' % (count, len(all_images)))

这是我刚刚运行的打印语句的输出示例,它再次生成了两个新的剪切图像(不同的对象,相同的两个图像)...这里的图像 2 是从未找到任何对象的图像.此外,有趣的是,每次运行每个图像时,“已经存在,跳过”语句的数量增加了两个。

Cutout of object already exists for this image, skipping...
Cutout of object already exists for this image, skipping...
Cutout of object already exists for this image, skipping...
Cutout of object already exists for this image, skipping...
Image 1 out of 3 completed
Image 2 out of 3 completed
Cutout of object already exists for this image, skipping...
Cutout of object already exists for this image, skipping...
Cutout of object already exists for this image, skipping...
Cutout of object already exists for this image, skipping...
Image 3 out of 3 completed

最佳答案

这是一个简单的错误:在 for 循环的末尾有一个 return 语句,这意味着每次运行 make_cutouts仅限于生产最多一个切口。每次运行它时,它都会生成第一个剪切,然后下一次,它会发现存在一个剪切,然后使用 continue 语句跳过它,然后获取下一个剪切,然后退出。删除 return 语句,代码可能会正常工作。

但是,有几件事您应该尽量避免:

(1) 您在函数中使用了全局变量。您最好将 objsras_hms 作为参数传递给函数,而不是依赖全局状态来访问它们。

(2) 当您可以遍历对象本身时,您正在遍历索引,即 for thisobj, thisra in zip(objs, ras_hms):

(3) 更小,但 if 'cutout-IMG-'+img_name+'-OBJ-'+objs[i]+'.fits' in glob.glob('cutout*.fits'): 会更有效 if os.path.exists(if 'cutout-IMG-'+img_name+'-OBJ-'+objs[i]+'.fits' in glob.glob('cutout *.fits'):。如果使用 'cutout-IMG-{img_name}-OBJ-{obj_id}.fits'.format(img_name=img_name, obj_id= objs[i]) 作为你的字符串

关于python - 为什么我的代码在每次运行后从相同图像中的相同列表中找到更多对象?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/54175325/

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