python - 在python中导入rds文件以将其读取为数据帧

Question

我对Python很陌生。我用 R 编写了脚本并做了很多分析。但现在我发现它应该转换为python。不管怎样，如果可能的话，我在将 rds 文件导入 python 时遇到问题。我已关注this post 。但是，它会导致此错误

import rpy2.robjects as robjects
from rpy2.robjects import pandas2ri
pandas2ri.activate()
readRDS = robjects.r['readRDS']
df = readRDS('clus_resf.rds')
df = pandas2ri.ri2py(df)
raise TypeError(msg.format(categories))

TypeError: Parameter 'categories' must be list-like, was <rpy2.rinterface.StrSexpVector - Python:0x2b45d8823e40 / R:0x2b451e7c6d80>

你可以在 this link 找到我的 rds 文件非常感谢，

Answer 1

使用 pyreadr 包看起来更容易，安装

pip install pyreadr

用法:

import pyreadr

result = pyreadr.read_r('test_data/basic/one.Rds')

# done! let's see what we got
print(result.keys()) # let's check what objects we got: there is only None
df1 = result[None] # extract the pandas data frame for the only object available

使用该包，您也可以从 python 编写 .rds 文件。