image - 在 MatLab 中打开正电子发射断层扫描 (PET) DICOM 图像并正确解释像素值？-6ren

image - 在 MatLab 中打开正电子发射断层扫描 (PET) DICOM 图像并正确解释像素值？

转载作者：太空宇宙更新时间：2023-11-03 20:35:38

我不熟悉如何通过原生制造商软件处理 DICOM 图像。我正在尝试将一组重建的经轴切片中的 PET 图像读入 MatLab。我的目的是做一些简单的分割，最后确定分割中的最大和最小像素值。但是，我无法将存储的值转换为在 native 系统上看到的值。

图像作为 int16 类加载到 MatLab 中。最大像素值始终为 32767，无论我从系列中加载哪个切片。通过在他们的本地系统上查看图像，我知道每个切片中的最大像素值是不同的。

我检查了重新缩放值和重新缩放截距值，重新缩放关系似乎是线性的。我应该做另一个更正吗？我假设所有其他校正(例如衰减、分散和随机)都是在重建过程中进行的。

任何帮助将不胜感激(希望我遗漏了一些简单的东西!)。我已经发布了从下面的标题中检索到的 DICOM 信息(别担心，这些图像是幻影的，因此没有患者识别数据).

问候，

罗斯

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                             PatientID: 'SOLID_TEST'
                      PatientBirthDate: ''
                            PatientSex: ''
                            PatientAge: ''
                           PatientSize: 0
                         PatientWeight: 0
                           EthnicGroup: ''
              AdditionalPatientHistory: ''
              Private_0017_GroupLength: 46
             Private_0017_10xx_Creator: 'GEMS_PETD_01'
                     Private_0017_1004: '20130207140047.00'
                AcquisitionGroupLength: 230
                        SliceThickness: 3.2700
       AcquisitionTerminationCondition: 'TIME'
             AcquisitionStartCondition: 'MANU'
         AcquisitionStartConditionData: 0
   AcquisitionTerminationConditionData: 0
                       SoftwareVersion: '41.04'
                          ProtocolName: 'WB 3D'
                           TriggerTime: 0
                             FrameTime: 0
                     IntervalsAcquired: 0
                     IntervalsRejected: 0
                ReconstructionDiameter: 700
                    GantryDetectorTilt: 0
                      FieldOfViewShape: 'CYLINDRICAL RING'
                 FieldOfViewDimensions: [2x1 double]
                        CollimatorType: 'NONE'
                   ActualFrameDuration: 180000
                       PatientPosition: 'HFS'
              Private_0019_GroupLength: 42
             Private_0019_10xx_Creator: 'GEMS_PETD_01'
                     Private_0019_1004: '20130207140602'
               RelationshipGroupLength: 322
                      StudyInstanceUID: [1x51 char]
                     SeriesInstanceUID: [1x49 char]
                               StudyID: '6893'
                          SeriesNumber: 401
                        InstanceNumber: 22
                  ImagePositionPatient: [3x1 double]
               ImageOrientationPatient: [6x1 double]
                   FrameOfReferenceUID: [1x59 char]
            PositionReferenceIndicator: 'SN'
                         SliceLocation: 1.8500
          ImagePresentationGroupLength: 218
                       SamplesPerPixel: 1
             PhotometricInterpretation: 'MONOCHROME2'
                                  Rows: 128
                               Columns: 128
                          PixelSpacing: [2x1 double]
                        CorrectedImage: [1x40 char]
                         BitsAllocated: 16
                            BitsStored: 16
                               HighBit: 15
                   PixelRepresentation: 1
               SmallestImagePixelValue: 0
                LargestImagePixelValue: 32767
                      RescaleIntercept: 0
                          RescaleSlope: 0.3555
                 LossyImageCompression: '00'
                     Unknown_0040_0000: 158
            AcquisitionContextSequence: [1x1 struct]
         NuclearAcquisitionGroupLength: 808
             EnergyWindowRangeSequence: [1x1 struct]
RadiopharmaceuticalInformationSequence: [1x1 struct]
                        NumberOfSlices: 47
                  TypeOfDetectorMotion: 'NONE'
        PatientOrientationCodeSequence: [1x1 struct]
PatientOrientationModifierCodeSequence: [1x1 struct]
 PatientGantryRelationshipCodeSequence: [1x1 struct]
                            SeriesType: 'STATIC\IMAGE'
                                 Units: 'BQML'
                          CountsSource: 'EMISSION'
               RandomsCorrectionMethod: 'SING'
           AttenuationCorrectionMethod: 'measured,, 0.096000 cm-1,'
                       DecayCorrection: 'START'
                  ReconstructionMethod: '3D IR'
           DetectorLinesOfResponseUsed: '0'
               ScatterCorrectionMethod: 'Model Based'
                             AxialMash: [2x1 double]
                        TransverseMash: 2
                CoincidenceWindowWidth: 0
                    FrameReferenceTime: 0
       PrimaryPromptsCountsAccumulated: 0
            SecondaryCountsAccumulated: 0
                SliceSensitivityFactor: 1
                           DecayFactor: 1.0095
                 DoseCalibrationFactor: 1139
                 ScatterFractionFactor: 0.3174
                        DeadTimeFactor: 1.1243
                            ImageIndex: 26
                  PixelDataGroupLength: 32780

最佳答案

我在 mammo 工作，没有 PET 经验，所以请对我在这里所说的持保留意见。

最大像素值为 32767，即 2 的 15 次方减 1。rescale 斜率不重要吗？

RescaleSlope: 0.3555

据推测，每个切片可能会有所不同，像素值应乘以该值(也应添加截距，但这是零)。

关于image - 在 MatLab 中打开正电子发射断层扫描 (PET) DICOM 图像并正确解释像素值？，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/18062702/

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