- android - 多次调用 OnPrimaryClipChangedListener
- android - 无法更新 RecyclerView 中的 TextView 字段
- android.database.CursorIndexOutOfBoundsException : Index 0 requested, 光标大小为 0
- android - 使用 AppCompat 时,我们是否需要明确指定其 UI 组件(Spinner、EditText)颜色
我有一个解剖体积图像 (B),它是一个索引图像 i、j、k:
B(1,1,1)=0 %for example.
该文件仅包含 0 和 1。
我可以用等值面正确地可视化它:等值面(B);
我想在 j 中的某个坐标处切割体积(每个体积都不同)。
问题是体积是垂直倾斜的,它可能有 45% 度,所以切割不会遵循解剖体积。
我想为数据获得一个新的正交坐标系,这样我在坐标 j 中的平面将以更准确的方式切割解剖体积。
有人告诉我用 PCA 来做,但我不知道如何做,阅读帮助页面也没有帮助。欢迎任何方向!
编辑:我一直在遵循这些建议,现在我得到了一个新的卷,以零为中心,但我认为轴没有按照它们应该的那样遵循解剖图像。这些是前后图像:
这是我用来创建图像的代码(我从答案中提取了一些代码,从评论中提取了一些想法):
clear all; close all; clc;
hippo3d = MRIread('lh_hippo.mgz');
vol = hippo3d.vol;
[I J K] = size(vol);
figure;
isosurface(vol);
% customize view and color-mapping of original volume
daspect([1,1,1])
axis tight vis3d;
camlight; lighting gouraud
camproj perspective
colormap(flipud(jet(16))); caxis([0 1]); colorbar
xlabel x; ylabel y; zlabel z
box on
% create the 2D data matrix
a = 0;
for i=1:K
for j=1:J
for k=1:I
a = a + 1;
x(a) = i;
y(a) = j;
z(a) = k;
v(a) = vol(k, j, i);
end
end
end
[COEFF SCORE] = princomp([x; y; z; v]');
% check that we get exactly the same image when going back
figure;
atzera = reshape(v, I, J, K);
isosurface(atzera);
% customize view and color-mapping for the check image
daspect([1,1,1])
axis tight vis3d;
camlight; lighting gouraud
camproj perspective
colormap(flipud(jet(16))); caxis([0 1]); colorbar
xlabel x; ylabel y; zlabel z
box on
% Convert all columns from SCORE
xx = reshape(SCORE(:,1), I, J, K);
yy = reshape(SCORE(:,2), I, J, K);
zz = reshape(SCORE(:,3), I, J, K);
vv = reshape(SCORE(:,4), I, J, K);
% prepare figure
%clf
figure;
set(gcf, 'Renderer','zbuffer')
% render isosurface at level=0.5 as a wire-frame
isoval = 0.5;
[pf,pv] = isosurface(xx, yy, zz, vv, isoval);
p = patch('Faces',pf, 'Vertices',pv, 'FaceColor','none', 'EdgeColor',[0.5 1 0.5]);
% customize view and color-mapping
daspect([1,1,1])
axis tight vis3d;view(-45,35);
camlight; lighting gouraud
camproj perspective
colormap(flipud(jet(16))); caxis([0 1]); colorbar
xlabel x; ylabel y; zlabel z
box on
任何人都可以提供可能发生的事情的提示吗?看来问题可能出在 reshape 命令上,是否有可能我正在取消之前完成的工作?
最佳答案
不确定 PCA,但这里有一个示例,展示了如何可视化 3D 标量体积数据,并在倾斜平面(非轴对齐)切割体积。代码的灵感来自 this demo在 MATLAB 文档中。
% volume data
[x,y,z,v] = flow();
vv = double(v < -3.2); % threshold to get volume with 0/1 values
vv = smooth3(vv); % smooth data to get nicer visualization :)
xmn = min(x(:)); xmx = max(x(:));
ymn = min(y(:)); ymx = max(y(:));
zmn = min(z(:)); zmx = max(z(:));
% let create a slicing plane at an angle=45 about x-axis,
% get its coordinates, then immediately delete it
n = 50;
h = surface(linspace(xmn,xmx,n), linspace(ymn,ymx,n), zeros(n));
rotate(h, [-1 0 0], -45)
xd = get(h, 'XData'); yd = get(h, 'YData'); zd = get(h, 'ZData');
delete(h)
% prepare figure
clf
set(gcf, 'Renderer','zbuffer')
% render isosurface at level=0.5 as a wire-frame
isoval = 0.5;
[pf,pv] = isosurface(x, y, z, vv, isoval);
p = patch('Faces',pf, 'Vertices',pv, ...
'FaceColor','none', 'EdgeColor',[0.5 1 0.5]);
isonormals(x, y, z, vv, p)
% draw a slice through the volume at the rotated plane we created
hold on
h = slice(x, y, z, vv, xd, yd, zd);
set(h, 'FaceColor','interp', 'EdgeColor','none')
% draw slices at axis planes
h = slice(x, y, z, vv, xmx, [], []);
set(h, 'FaceColor','interp', 'EdgeColor','none')
h = slice(x, y, z, vv, [], ymx, []);
set(h, 'FaceColor','interp', 'EdgeColor','none')
h = slice(x, y, z, vv, [], [], zmn);
set(h, 'FaceColor','interp', 'EdgeColor','none')
% customize view and color-mapping
daspect([1,1,1])
axis tight vis3d; view(-45,35);
camlight; lighting gouraud
camproj perspective
colormap(flipud(jet(16))); caxis([0 1]); colorbar
xlabel x; ylabel y; zlabel z
box on
下面是显示等值面渲染为线框的结果,此外还有轴对齐和旋转的切片平面。我们可以看到等值面内侧的体积空间值为1,外侧为0
关于matlab - PCA 在 3D 图像上获得 3 个主轴,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/18454787/
我正在尝试学习 Knockout 并尝试创建一个照片 uploader 。我已成功将一些图像存储在数组中。现在我想回帖。在我的 knockout 码(Javascript)中,我这样做: 我在 Jav
我正在使用 php 编写脚本。我的典型问题是如何在 mysql 中添加一个有很多替代文本和图像的问题。想象一下有机化学中具有苯结构的描述。 最有效的方法是什么?据我所知,如果我有一个图像,我可以在数据
我在两个图像之间有一个按钮,我想将按钮居中到图像高度。有人可以帮帮我吗? Entrar
下面的代码示例可以在这里查看 - http://dev.touch-akl.com/celebtrations/ 我一直在尝试做的是在 Canvas 上绘制 2 个图像(发光,然后耀斑。这些图像的链接
请检查此https://jsfiddle.net/rhbwpn19/4/ 图像预览对于第一篇帖子工作正常,但对于其他帖子则不然。 我应该在这里改变什么? function readURL(input)
我对 Canvas 有疑问。我可以用单个图像绘制 Canvas ,但我不能用单独的图像绘制每个 Canvas 。- 如果数据只有一个图像,它工作正常,但数据有多个图像,它不工作你能帮帮我吗? va
我的问题很简单。如何获取 UIImage 的扩展类型?我只能将图像作为 UIImage 而不是它的名称。图像可以是静态的,也可以从手机图库甚至文件路径中获取。如果有人可以为此提供一点帮助,将不胜感激。
我有一个包含 67 个独立路径的 SVG 图像。 是否有任何库/教程可以为每个路径创建单独的光栅图像(例如 PNG),并可能根据路径 ID 命名它们? 最佳答案 谢谢大家。我最终使用了两个答案的组合。
我想将鼠标悬停在一张图片(音乐专辑)上,然后播放一张唱片,所以我希望它向右移动并旋转一点,当它悬停时我希望它恢复正常动画片。它已经可以向右移动,但我无法让它随之旋转。我喜欢让它尽可能简单,因为我不是编
Retina iOS 设备不显示@2X 图像,它显示 1X 图像。 我正在使用 Xcode 4.2.1 Build 4D502,该应用程序的目标是 iOS 5。 我创建了一个测试应用(主/细节)并添加
我正在尝试从头开始以 Angular 实现图像 slider ,并尝试复制 w3school基于图像 slider 。 下面我尝试用 Angular 实现,谁能指导我如何使用 Angular 实现?
我正在尝试获取图像的图像数据,其中 w= 图像宽度,h = 图像高度 for (int i = x; i imageData[pos]>0) //Taking data (here is the pr
我的网页最初通过在 javascript 中动态创建图像填充了大约 1000 个缩略图。由于权限问题,我迁移到 suPHP。现在不用标准 标签本身 我正在通过这个 php 脚本进行检索 $file
我正在尝试将 python opencv 图像转换为 QPixmap。 我按照指示显示Page Link我的代码附在下面 img = cv2.imread('test.png')[:,:,::1]/2
我试图在这个 Repository 中找出语义分割数据集的 NYU-v2 . 我很难理解图像标签是如何存储的。 例如,给定以下图像: 对应的标签图片为: 现在,如果我在 OpenCV 中打开标签图像,
import java.util.Random; class svg{ public static void main(String[] args){ String f="\"
我有一张 8x8 的图片。 (位图 - 可以更改) 我想做的是能够绘制一个形状,给定一个 Path 和 Paint 对象到我的 SurfaceView 上。 目前我所能做的就是用纯色填充形状。我怎样才
要在页面上显示图像,你需要使用源属性(src)。src 指 source 。源属性的值是图像的 URL 地址。 定义图像的语法是: 在浏览器无法载入图像时,替换文本属性告诉读者她们失去的信息。此
**MMEditing是基于PyTorch的图像&视频编辑开源工具箱,支持图像和视频超分辨率(super-resolution)、图像修复(inpainting)、图像抠图(matting)、
我正在尝试通过资源文件将图像插入到我的程序中,如下所示: green.png other files 当我尝试使用 QImage 或 QPixm
我是一名优秀的程序员,十分优秀!