python - 为什么 'rmagic' %R 在读取文件时会导致错误，而 %%R 不会？

Question

使用rmagic，在读取 a particular file 时，%R 和 %%R 之间的行为不一致(而不是其他人):为什么

%%R

usda = read.csv("USDA.csv")

工作的同时

%R usda = read.csv("USDA.csv")

失败

---------------------------------------------------------------------------
TypeError                                 Traceback (most recent call last)
<ipython-input-64-01ec3b4742c8> in <module>()
----> 1 get_ipython().magic(u'R usda = read.csv("USDA.csv")')

...

/Library/Python/2.7/site-packages/numpy/core/numeric.pyc in asarray(a, dtype, order)
    458 
    459     """
--> 460     return array(a, dtype, copy=False, order=order)
    461 
    462 def asanyarray(a, dtype=None, order=None):

TypeError: __float__ returned non-float (type rpy2.rinterface.NAIntegerType)

同样，这只发生在 the linked file 上。 ，而不是我尝试过的任何其他人。

Answer 1

这是我以前见过的缺失值处理问题。每当您有缺失值时，它都应该发生。我不确定我们是否应该将其视为错误。但是%R -n usda = read.csv('USDA.csv')使用 numpy 抑制返回(a array -n )将避免这个问题。

还应该注意，如果您 %Rpull usda之后%R -n usda = read.csv('USDA.csv') ，您应该同样得到相同的异常。

如果你想在 python 之间来回传输数据和R在这种情况下，请使用 pandas 读取它然后convert_to_r_dataframe和convert_robject我认为效果会更好。