c# - 如何过滤 HDF5 文件中的特定对象

Question

学习ILNumerics HDF5 API 。我真的很喜欢使用 C# 对象初始值设定项在一个表达式中设置复杂 HDF5 文件的选项。我创建了以下文件:

using (var f = new H5File("myFile.h5")) {

    f.Add(new H5Group("myTopNode") {
        new H5Dataset("dsNo1", ILMath.vec<float>(1,200)),  // no attributes 
        new H5Group("myGroup") {
            new H5Dataset("dsYes", ILMath.rand(100,200)) { // matching dataset
                Attributes = { 
                    { "att1", 1 },
                    { "att2", 2 } 
                }
            }, 
            new H5Dataset("dsNo2") {  // attributes but wrong name
                Attributes = { 
                    { "wrong1", -100 },
                    { "wrong2", -200 } 
                }
            }
        }
    });
}

现在我正在寻找一种巧妙的方法来迭代文件并过滤具有特定属性的数据集。 我想找到所有至少具有一个名称中包含“att”属性的数据集，收集并返回其内容。这是我到目前为止所做的:

IList<ILArray<double>> list = new List<ILArray<double>>();
using (var f = new H5File("myFile.h5")) {
    var groups = f.Groups;
    foreach (var g in groups) {
        foreach (var obj in g) {
            if (obj.H5Type == H5ObjectTypes.Dataset && obj.Name.Contains("ds")) {
                var ds = obj as H5Dataset;
                // look for attributes 
                foreach (var att in ds.Attributes) {
                    //ds.Attributes["att"].
                    if (att.Name.Contains("att")) {
                        list.Add(ds.Get<double>());
                    }
                }
            }
        }
    }
}
return list; 

但它不能递归地工作。我可以采用它，但 ILNumerics 声称很方便，所以一定有更好的方法吗？类似于 python 中的 h5py 吗？

Answer 1

H5Group提供Find<T>方法正是您正在寻找的。它迭代整个子树，考虑任意谓词:

var matches = f.Find<H5Dataset>(
                 predicate: ds => ds.Attributes.Any(a => a.Name.Contains("att")));

为什么不让你的函数返回“ILCell”而不是“List”？这可以更好地集成到 ILNumerics 内存管理中(不会有任何存储等待垃圾收集器到来):

using (var f = new H5File("myFile.h5")) {
    // create container for the dataset contents
    ILCell c = cell(size(1, 1)); // one element init

    // retrieve datasets filtered
    var matches = f.Find<H5Dataset>(predicate: ds => {
        if (ds.Attributes.Any(a => a.Name.Contains("att"))) {
            c[end + 1] = ds.Get<double>();
            return true; 
        }
        return false; 
    });
    return c; 
}

一些链接:

http://ilnumerics.net/hdf5-interface.html

http://ilnumerics.net/Cells.html

http://ilnumerics.net/GeneralRules.html