- android - 多次调用 OnPrimaryClipChangedListener
- android - 无法更新 RecyclerView 中的 TextView 字段
- android.database.CursorIndexOutOfBoundsException : Index 0 requested, 光标大小为 0
- android - 使用 AppCompat 时,我们是否需要明确指定其 UI 组件(Spinner、EditText)颜色
我有一个函数,我想在知道曲线拟合误差的情况下进行曲线拟合。我正在尝试使用 scipy.optimize.curve_fit 来执行此操作,但遇到了问题。现在我的代码是:
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from scipy.optimize import curve_fit
pi = np.pi
sqrt = np.sqrt
mean = np.mean
A = 1
T_2 = 100
nu_0 = 10
phi_0 = 0
n = .001
nu_s = 500
T = 1000
t = np.linspace(0, T, num = (nu_s*T))
def S_n(A,t,T_2,nu_0,phi_0,n,nu_s,T):
return (A/np.sqrt(2))*np.exp(-t/T_2)*np.cos(2*pi*nu_0*t+phi_0)
S = S_n(A,t,T_2,nu_0,phi_0,n,nu_s,T) + np.random.normal(0, n, nu_s*T)
guess = np.array([A,T_2,nu_0,phi_0,n,nu_s,T])
print guess
popt, pcov = curve_fit(S_n,t,S, guess)
print popt
perr = sqrt(np.diag(pcov))
print perr
这给了我无限的错误。我不确定我的猜测是否正确,因为在方程中,除了 t 之外,所有内容都保持不变,所以我是否将 t 排除在猜测之外,因为它不再是数组,因为 t 是一个序列。当我将 t 排除在猜测之外时(我在这里所做的),我收到的每个变量的值与我最初给出的值相差甚远,且误差无限。如果我在猜测中包含 t,则会收到错误。
最佳答案
您没有考虑 curve_fit
参数的顺序:
Definition: curve_fit(f, xdata, ydata, p0=None, sigma=None, **kw)
Docstring: Use non-linear least squares to fit a function, f, to data.
Assumes
ydata = f(xdata, *params) + eps
Parameters
f : callable The model function, f(x, ...). It must take the independent variable as the first argument and the parameters to fit as separate remaining arguments.
如果你创建一个函数:
def Sm(t, A,T_2,nu_0,phi_0,n,nu_s,T):
return S_n(A, t, T_2,nu_0,phi_0,n,nu_s,T)
(注意前两个参数的顺序已更改)并将其传递给curve_fit
,它将起作用。
不过,清理你的原始函数可能更Pythonic:
def S_n(t, A, T_2, nu_0, phi_0, n, nu_s, T):
return (A/np.sqrt(2))*np.exp(-t/T_2)*np.cos(2*pi*nu_0*t+phi_0)
S = S_n(t, A, T_2, nu_0, phi_0, n, nu_s, T) + np.random.normal(0, n, nu_s*T)
然后您可以将 S_n
不变地传递给 curve_fit
,以及 S
和 guess
。
需要明确的是,以下代码可产生所需的配合:
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from scipy.optimize import curve_fit
def S_n(t, amplitude, sigma,freq0,phase):
return (amplitude/np.sqrt(2))*np.exp(-t/sigma)*np.cos(2*np.pi*freq0*t+ phase)
amplitude = 1
sigma = 100
freq0 = 10
phase = 0
n = .001
sample_freq = 500
period = 1000
t = np.linspace(0, period, num = (sample_freq*period))
S = S_n(t, amplitude, sigma,freq0,phi_0) + np.random.normal(0, n, sample_freq*period)
guess = np.array([amplitude, sigma, freq0, phase ])
print guess
popt, pcov = curve_fit(S_n,t,S, guess)
print popt
print(np.all(np.isfinite(pcov)))
# output
[ 1 100 10 0]
[ 1.00000532e+00 1.00000409e+02 1.00000000e+01 -1.49076430e-05]
True
关于python - 使用 scipy curve_fit 进行猜测,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/27993036/
我在使用 cx_freeze 和 scipy 时无法编译 exe。特别是,我的脚本使用 from scipy.interpolate import griddata 构建过程似乎成功完成,但是当我尝试
是否可以通过函数在 scipy 中定义一个稀疏矩阵,而不是列出所有可能的值?在文档中,我看到可以通过以下方式创建稀疏矩阵 There are seven available sparse matrix
SciPy为非线性最小二乘问题提供了两种功能: optimize.leastsq()仅使用Levenberg-Marquardt算法。 optimize.least_squares()允许我们选择Le
SciPy 中的求解器能否处理复数值(即 x=x'+i*x")?我对使用 Nelder-Mead 类型的最小化函数特别感兴趣。我通常是 Matlab 用户,我知道 Matlab 没有复杂的求解器。如果
我有看起来像这样的数据集: position number_of_tag_at_this_position 3 4 8 6 13 25 23 12 我想对这个数据集应用三次样条插值来插值标签密度;为此
所以,我正在处理维基百科转储,以计算大约 5,700,000 个页面的页面排名。这些文件经过预处理,因此不是 XML 格式。 它们取自 http://haselgrove.id.au/wikipedi
Scipy 和 Numpy 返回归一化的特征向量。我正在尝试将这些向量用于物理应用程序,我需要它们不被标准化。 例如a = np.matrix('-3, 2; -1, 0') W,V = spl.ei
基于此处提供的解释 1 ,我正在尝试使用相同的想法来加速以下积分: import scipy.integrate as si from scipy.optimize import root, fsol
这很容易重新创建。 如果我的脚本 foo.py 是: import scipy 然后运行: python pyinstaller.py --onefile foo.py 当我启动 foo.exe 时,
我想在我的代码中使用 scipy.spatial.distance.cosine。如果我执行类似 import scipy.spatial 或 from scipy import spatial 的操
Numpy 有一个基本的 pxd,声明它的 c 接口(interface)到 cython。是否有用于 scipy 组件(尤其是 scipy.integrate.quadpack)的 pxd? 或者,
有人可以帮我处理 scipy.stats.chisquare 吗?我没有统计/数学背景,我正在使用来自 https://en.wikipedia.org/wiki/Chi-squared_test 的
我正在使用 scipy.odr 拟合数据与权重,但我不知道如何获得拟合优度或 R 平方的度量。有没有人对如何使用函数存储的输出获得此度量有建议? 最佳答案 res_var Output 的属性是所谓的
我刚刚下载了新的 python 3.8,我正在尝试使用以下方法安装 scipy 包: pip3.8 install scipy 但是构建失败并出现以下错误: **Failed to build sci
我有 my own triangulation algorithm它基于 Delaunay 条件和梯度创建三角剖分,使三角形与梯度对齐。 这是一个示例输出: 以上描述与问题无关,但对于上下文是必要的。
这是一个非常基本的问题,但我似乎找不到好的答案。 scipy 到底计算什么内容 scipy.stats.norm(50,10).pdf(45) 据我了解,平均值为 50、标准差为 10 的高斯中像 4
我正在使用 curve_fit 来拟合一阶动态系统的阶跃响应,以估计增益和时间常数。我使用两种方法。第一种方法是在时域中拟合从函数生成的曲线。 # define the first order dyn
让我们假设 x ~ Poisson(2.5);我想计算类似 E(x | x > 2) 的东西。 我认为这可以通过 .dist.expect 运算符来完成,即: D = stats.poisson(2.
我正在通过 OpenMDAO 使用 SLSQP 来解决优化问题。优化工作充分;最后的 SLSQP 输出如下: Optimization terminated successfully. (Exi
log( VA ) = gamma - (1/eta)log[alpha L ^(-eta) + 测试版 K ^(-eta)] 我试图用非线性最小二乘法估计上述函数。我为此使用了 3 个不同的包(Sc
我是一名优秀的程序员,十分优秀!