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python - 使用互信息作为相似性度量的分层聚类？

转载作者：太空宇宙更新时间：2023-11-03 17:58:13

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我想使用scipy.cluster.hierarchy.linkage计算我的数据的链接结构。我需要使用的相似性度量是 Mutual Information 。我可以轻松计算出相应的相似度矩阵。但是，linkage 函数仅接受距离矩阵。

使用 scipy(或另一个 python 库)，如何使用互信息作为相似性度量来计算链接结构？我可以将相似矩阵转换为距离矩阵吗？

最佳答案

根据paragraph on wikipedia @cel 指出的 Jaccard distance是互信息的距离变体。模块distance.pdist scipy 支持使用 Jaccard 距离计算距离矩阵。

关于python - 使用互信息作为相似性度量的分层聚类？，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/28191052/

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