ubuntu - 如何在奇点图像中安装 ubuntu 软件包？

Question

我在 CentOS 6.6 系统上工作。我有一个可写的奇点 ubuntu 16.04 图像，我知道我实际上可以写入:

[root@qmaster02]# whoami
root
[root@qmaster02]# singularity shell --writable gtn
Singularity: Invoking an interactive shell within container...

Singularity gtn:~> ls /opt/
ZFP  bart-0.3.01  code  manifest.json  start_supervisor  supervisord.conf  v0.3.01.tar.gz
Singularity gtn:~> touch /opt/mynewfile
Singularity gtn:~> ls /opt/
ZFP  bart-0.3.01  code  manifest.json  mynewfile  start_supervisor  supervisord.conf  v0.3.01.tar.gz

我现在尝试安装一个新包，但出现以下错误:

Singularity gtn:~> apt-get install module-init-tools
Reading package lists... Error!
E: Could not read from /var/lib/apt/lists/archive.ubuntu.com_ubuntu_dists_xenial-updates_InRelease - getline (12: Cannot allocate memory)
E: The package lists or status file could not be parsed or opened.

检查 /var/lib/apt/lists/archive.ubuntu.com_ubuntu_dists_xenial-updates_InRelease，它只是一个末尾带有签名的哈希和文件。

问题:如何在奇点环境中使用 apt-get 安装软件包？

Answer 1

奇点容器可能是可写的，但没有足够的空间来写入更多信息。这可能是您在这里遇到的问题。

您可以通过运行来增加磁盘镜像:

singularity image.expand container.img

或者我相信 Singularity 2.3 及以下版本使用:

singularity expand container.img

可选地使用大小参数

-s|--size

image.expand 默认将图像大小增加 768MiB。

之后，安装应该按照描述进行。