Python: 'numpy.ndarray' 对象没有属性 'violinplot'

Question

过去几周我一直在使用 matplotlib，学习如何制作不同的图表等。我目前处于静止状态。我正在处理基因表达数据，因此我有一个 csv 文件，其中包含 3 列数据(突变、移码和非突变)。但是，我正在尝试制作 fiddle 图，但不断收到错误:

Traceback (most recent call last):
  File "/home/fmohamed/Documents/violinplot_script.py", line 39, in <module>
    axes.violinplot(all_data,
AttributeError: 'numpy.ndarray' object has no attribute 'violinplot'

我不确定我做错了什么，但我的代码位于下面:

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import csv

#import data:
with open('/home/fmohamed/Documents/oc_data.csv') as csvfile:
    spamreader = csv.reader(csvfile, delimiter = ' ')
    array = []
    for row in spamreader:
           array.append(row)

# sort out bad data:
splitArray = [row[0].split(',') for row in array]
splitArray = [row for row in splitArray if row[0] != '' and row[1] != '' and 
row[2] != '']
descr = splitArray[0]
splitArray.pop(0) #remove the column descriptions from array
all_data = []
for row in splitArray:
    all_data.append(float(row[0]))
    all_data.append(float(row[1]))
    all_data.append(float(row[2]))

all_data = np.array(all_data)

fig, axes = plt.subplots(nrows=1, ncols=3, figsize=(12, 5))

# plot violin plot
axes.violinplot(all_data,
               showmeans=False,
               showmedians=False)
axes.set_title('violin plot')


# adding horizontal grid lines
axes.yaxis.grid(True)
axes.set_xticks([y+1 for y in range(len(all_data))])
axes.set_xlabel('xlabel')
axes.set_ylabel('ylabel')

# add x-tick labels
plt.setp(axes, xticks=[y+1 for y in range(len(all_data))],
     xticklabels=['mutated', 'frameshift', 'nonmutated'])

plt.show()

预先感谢大家提供的任何帮助。

Answer 1

检查 matplotlib 的版本，因为 fiddle 图仅自 matplotlib 1.4 起可用。 。要检查 matplotlib 版本，只需在 python 终端中输入:

>>> import matplotlib
>>> print matplotlib.__version__