python - 运行一个 shell 脚本，该脚本运行一个 python 程序，然后运行一个 R 程序

Question

我有一个 shell 脚本，它运行一个 Python 程序来预处理一些数据，然后运行一个 R 程序来执行一些长时间运行的任务。我正在学习使用 Docker 并且我一直在运行

FROM r-base:latest
FROM python
COPY . /usr/local/src/scripts
WORKDIR /usr/local/src/scripts
CMD ["./myscript.sh"]

据我了解，它执行以下操作:

1. 获取 R
2. 获取 Python
3. 将当前目录复制到 /usr/local/src/scripts
4. 将目录更改为/usr/local/src/scripts
5. 运行./myscript.sh

在 myscript.sh 中，我使用 R CMD ... 语法来运行我的 R 脚本。但是，当运行此 docker 镜像时，我收到以下错误:

./myscript.sh: line 8: R: command not found

这表明该脚本在容器内运行时无法识别 R 程序。我可以确认 ./myscript.sh 在本地工作，但我无法公开任何专有代码。

Answer 1

FROM 命令设置 Dockerfile 构建的基础镜像。您应该只拥有其中之一。之后，如果您需要基础镜像中没有的其他工具，请运行使用依赖于平台的包管理器的命令，例如

RUN apt-get update && apt-get install -y \
    package-foo \
    package-bar

这适用于基于 Debian 的镜像，例如 Ubuntu。