ruby - 在 Ruby 中替换字节类型 NArray 中的值

Question

我正在寻找一种方法，将字节数组中所有出现的“A”替换为 1、“T”替换为 2、“C”替换为 8、“G”替换为 16。如何做到这一点？

Answer 1

require "narray"

class NArray
  def cast(type)
    a = NArray.new(type,*self.shape)
    a[] = self
    a
  end
end

conv = NArray.int(256)
atcg = NArray.to_na('ATCG', NArray::BYTE).cast(NArray::LINT)
conv[atcg] = [1,2,8,16]

seq_str = 'ABCDAGDE'
seq_ary = NArray.to_na(seq_str, NArray::BYTE).cast(NArray::LINT)

p conv[seq_ary]
#=> NArray.int(8):
#   [ 1, 0, 8, 0, 1, 16, 0, 0 ]