python - 无法在 ubuntu 11.10 中安装 rdkit

Question

我花了很多时间尝试在 ubuntu 11.10 上构建 RDKitPython 2.7 (rdkit_201106+dfsg.orig.tar.gz) 使用预编译版本提升 1.49。我失败得很惨。

重复出现的错误在 CMake GUI 中:

 CMake Error at CMakeLists.txt:11 (install):

  install FILES given no DESTINATION!



  CMake Error at CMakeLists.txt:14 (add_pytest):


  Unknown CMake command "add_pytest".

有什么帮助吗？

解决了之前的问题，但现在我在运行 python 时遇到此错误，即使我按照安装过程安装了 rdkit:

 from rdkit import Chem
 Traceback (most recent call last):
   File "<stdin>", line 1, in <module>
 ImportError: No module named rdkit

Answer 1

确保设置了环境变量:(您可能需要用现有的路径修复路径):在 Mac 上使用 bash:

export RDBASE=/usr/local/share/RDKit
export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:/usr/local/lib/python2.7/site-packages

您可能希望将这些行添加到 bash 脚本中以自动执行该过程。