python - PyCharm 如何将 RDKit 添加到项目中？

Question

因此，我正在尝试将 RDKit 添加到我在 PyCharm 中的项目中。我发现，如果您使用的是解释器 /usr/bin/python2.7，PyCharm 将尝试使用 pip 安装内容。而 RDKit 需要 conda。我试图将解释器更改为 conda，但 RDKit 要么不在列表中，要么无法打开 repo 的 URL。有谁知道如何解决这个问题？

顺便说一句，在安装东西时，是否可以在保留解释器 /usr/bin/python2.7 的同时使其使用其他任何东西(不是 pip) ？

Answer 1

我终于找到了怎么做，一点也不难:

1. 安装conda；
2. 按照 these instructions 安装 RDKit
3. 像这样转到 PyCharm 中的首选项:

或者像这样(你需要一把 Spanner ):

1. 在项目解释器中选择:~/anaconda/envs/my-rdkit-env/bin/python

2. 确保将相应的 python 路径添加或更新到 PATH，否则将无法运行。

测试:

1. 尝试安装 fiona - 成功，因此对安装没有影响；
2. 尝试了简单的代码:print('HELLO WORLD!') - 工作

3. 试过rdkit代码

       from rdkit import Chem
   
   
       m = Chem.MolFromSmiles('Cc1ccccc1')
   
       print(m)
   

成功了，日志:<rdkit.Chem.rdchem.Mol object at 0x101125080>